本課題主要從以下六個層次著重分析地方政府間跨區(qū)域合作治理行政制度的創(chuàng)新路徑： 一是行政機(jī)構(gòu)設(shè)置層面。主要包括建立區(qū)域性地方政府聯(lián)盟、地方性公共事務(wù)管理局、綜合性政績考核制度、多元性評估體系等。 二是聯(lián)席會議制度層面。主要從基本概念、存在問題和原因以及創(chuàng)新路徑角度分析不具有行政隸屬關(guān)系的地方政府或職能部門，通過行政首長或部門領(lǐng)導(dǎo)的定期或不定期會晤，商討區(qū)域合作中面臨的重大問題，并在平等協(xié)商的基礎(chǔ)上達(dá)成相關(guān)的合作協(xié)議，如何以解決跨區(qū)域合作治理過程中遇到的問題。 三是利益協(xié)調(diào)機(jī)制層面。主要分析跨區(qū)域治理中地方政府間利益協(xié)調(diào)機(jī)制的概念、形式和類型，影響因素以及利益形成機(jī)制、利益補(bǔ)償機(jī)制，利益分享機(jī)制和利益約束機(jī)制方面的建構(gòu)路徑； 四是行政運(yùn)行機(jī)制層面。主要包括建立信息交互機(jī)制，危機(jī)應(yīng)對機(jī)制、評價考核機(jī)制，吸納退出機(jī)制、行為約束機(jī)制等。 五是行政制度環(huán)境層面。主要包括選擇多樣化區(qū)域治理模式，建立區(qū)域合作公約，簽訂府際服務(wù)契約，設(shè)立區(qū)域共同發(fā)展基金，構(gòu)建地方公共組織網(wǎng)絡(luò)關(guān)系等。 六是行政制度主體層面。主要包括樹立可持續(xù)發(fā)展的區(qū)域合作觀和區(qū)域共贏理念，制定統(tǒng)一的區(qū)域戰(zhàn)略合作規(guī)劃，實(shí)施“和而不同”的區(qū)域整合政策，加強(qiáng)地方政府人力資源建設(shè)等。