《尹昌衡集(1冊)》
　一 文電
　改名為尹昌衡（1908年12月1日前后）
　附錄小村壽太郎致寺內(nèi)正毅函（1908年12月14日）
　圣私篇（1909年留日回國前）
　武德論（1910年5、6月）
　圣武篇（1910年6月21日）
　兵事綱要（1911年4月13日）
　告全蜀父老兄弟文（1911年12月10日）
　再告全蜀父老兄弟文（1911年12月10日）
　告示一（1911年12月中旬）
　告示二（1911年12月中旬）
　文告一束（1911年12月22日）
　與羅綸宣布就職通告（1911年12月27日）
　致重慶蜀軍政府書（1911年12月29日）

《尹昌衡集(1冊)》
　一 文電
　改名為尹昌衡（1908年12月1日前后）
　附錄小村壽太郎致寺內(nèi)正毅函（1908年12月14日）
　圣私篇（1909年留日回國前）
　武德論（1910年5、6月）
　圣武篇（1910年6月21日）
　兵事綱要（1911年4月13日）
　告全蜀父老兄弟文（1911年12月10日）
　再告全蜀父老兄弟文（1911年12月10日）
　告示一（1911年12月中旬）
　告示二（1911年12月中旬）
　文告一束（1911年12月22日）
　與羅綸宣布就職通告（1911年12月27日）
　致重慶蜀軍政府書（1911年12月29日）
　頒發(fā)捕殺趙爾豐獎狀文（1911年12月）
　宣布四川獨立及兵變經(jīng)過通告（1911年12月）
　附錄成都獨立后與清廷趙爾瘋所訂條約
　宣慰雅州父老文（1911年12月）
　通飭清查各路同志軍真?zhèn)卧��?911年12月）
　……
　
《尹昌衡集(2冊)》
　二詩歌
　甲寅以前稿
　桂林贈陸干卿
　感懷
　送唐萁菮、劉積之赴滇練兵
　自題同胞小照
　桂林城中冒雨立馬獨秀峰危崖觀雁五近一首
　困極有感
　西征寄內(nèi)
　西征夜行軍
　西征思親
　西征抱病
　瘞卒
　奏凱
　思解職讀書一首
　西征寄內(nèi)
　大覺悟
　將軍觀
　無題
　……
　
《尹昌衡集(3冊)》
　經(jīng)術(shù)訐時
　自題
　訐原
　訐鄰
　訐極
　訐官
　訐民
　訐教
　訐法
　訐政
　訐陟
　訐罰
　訐兵
　訐黨
　訐言
　訐藩
　訐才
　訐議
　訐財
　訐學(xué)
　訐普
　訐志
　訐謀
　訐藝
　……
　
《尹昌衡集(4冊)》
　寓言
　序
　序二
　序三
　序四
　序五
　第一卷春
　尹樂
　張良
　佛老
　堯舜
　鄭康成
　揚雄
　陳摶
　指鹿
　莊、屈
　仲尼
　說法
　憂國
　齊威王
　趙威后
　焦贛
　齊家
　化蠶
　……
　
《尹昌衡集(5冊)》
　唯白論
　萬法唯白
　止園書局發(fā)行《唯白論》內(nèi)容略說
《止園唯白論》序
　勾弦略評
　開宗圖
　內(nèi)皇外者之圖
　內(nèi)篇?綱言
　內(nèi)篇?釋文
　惟樂統(tǒng)萬
　唯白論
　原白
　白樂合
　述“頡羅經(jīng)”
　宇宙唯白
　頌白
　五教開源
　八識規(guī)矩
　懲私欲
　究事理
　立三理
　真理
　物理
　事理
　……