大奇和小遇是一對熱愛動物的兄妹。有一天，爸爸媽媽領著他們參觀野生動物園，在一陣野鴨鳴叫聲的指引下，兄妹倆無意間打開了山海經野生動物園的大門。那是一個與眾不同的動物園，分為六個場館：飛鳥云集的羽門館、猿猴長嘯的禺門館、野獸兇猛的毛門館、龜蛇交纏的昆門館、蛙聲一片的蠃門館，還有魚躍江海的鱗門館。

大奇和小遇很快被眼前奇異的景象迷住了，而這只是他們走進山海經野生動物園的步。在這里，他們遇見了博學的大眼睛老師，還有兩個來自遠古時空的好朋友小山和小海。大家一起登上觀光車，將在這個美麗而神奇的世界中暢快地遨游，他們會見到什么樣的神奇動物呢？