我國的高等教育撥款制度是指政府向高等院校撥付供其發(fā)展的資金的制度安排，其伴隨著我國經(jīng)濟體制、教育體制和財政體制的改革而不斷改進。

高等教育經(jīng)費的撥付方式通常情況下可以分為兩種：一種是直接撥款方式，一種是間接撥款方式。

高等教育撥款制度作為一個制度系統(tǒng)，至少應當包含體制、機制、模式三個方面的要素。

目前，我國的高等教育撥款制度主要實行的是政府直接面對高等院校的二元結構下的分級撥款體制、投入型的撥款機制以及“基本支出預算加項目支出預算”的撥款模式。

但根據(jù)《統(tǒng)籌推進世界一流大學和一流學科建設總體方案》的規(guī)定，我國高等教育撥款制度呈現(xiàn)出一種趨勢：第三方參與評價體制下以績效撥款模式為主的產(chǎn)出型撥款機制三要素相協(xié)調的制度設計。