缺氧誘導(dǎo)小分子RNA調(diào)控腎癌侵襲轉(zhuǎn)移的分析與研究/同濟(jì)博士論叢
定 價(jià):70 元
叢書名:同濟(jì)博士論叢
- 作者:李偉,鄭軍華 著,伍江 編
- 出版時(shí)間:2019/9/1
- ISBN:9787560887616
- 出 版 社:同濟(jì)大學(xué)出版社
- 中圖法分類:R737.11
- 頁碼:136
- 紙張:膠版紙
- 版次:1
- 開本:16開
《缺氧誘導(dǎo)小分子RNA調(diào)控腎癌侵襲轉(zhuǎn)移的分析與研究/同濟(jì)博士論叢》借助高通量基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫,使用生物信息學(xué)方法,分析腎細(xì)胞癌的高通量測序大數(shù)據(jù),進(jìn)而通過miRNA芯片技術(shù),分析臨床ccRcc患者腫瘤與癌旁組織中的miRNAs,兩者交叉驗(yàn)證,篩選出參與腎癌發(fā)病過程的miRNAs,探究其作用機(jī)制,最終為檢測和治療腎癌提供新的理論依據(jù),從而促進(jìn)腎癌的機(jī)制研究、臨床診斷和治療!度毖跽T導(dǎo)小分子RNA調(diào)控腎癌侵襲轉(zhuǎn)移的分析與研究/同濟(jì)博士論叢》適合高校醫(yī)學(xué)專業(yè)師生及相關(guān)研究人員閱讀。
總序
論叢前言
前言
第1章 GEO中腎透明細(xì)胞癌高通量測序數(shù)據(jù)庫的生物信息學(xué)分析
1.1 概述
1.2 疾病相關(guān)的基因芯片數(shù)據(jù)庫發(fā)掘臨床腫瘤新標(biāo)靶
第2章 人腎透明細(xì)胞癌中的miRNA表達(dá)譜芯片檢測及靶基因分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)備及主要儀器
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑及試劑盒
2.1.3 miRNA芯片實(shí)驗(yàn)方法
2.2 miRNA芯片數(shù)據(jù)的分析方法
2.2.1 差異miRNA的篩選
2.2.2 基因功能的顯著性分析(G0-Analysis)
2.2.3 基因通路的顯著性分析(Pathway-Analysis)
2.3 結(jié)果
2.3.1 腎癌標(biāo)本臨床及病理資料
2.3.2 miRNA芯片實(shí)驗(yàn)結(jié)果和熱圖分析
2.3.3 腎癌標(biāo)本中差異miRNAs的靶基因分析
2.3.4 腎癌標(biāo)本中差異靶基因的顯著性功能分析(GO Analysis)
2.3.5 腎癌標(biāo)本中差異基因的顯著性pathway分析和其調(diào)控網(wǎng)路分析
2.4 討論
2.5 結(jié)論
第3章 腎透明細(xì)胞癌組織中miR-646、相關(guān)基因檢測及其與腫瘤患者臨床相關(guān)因素分析
3.1 材料
3.1.1 臨床樣本
3.1.2 實(shí)驗(yàn)用試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)用儀器
3.2 方法
3.2.1 miRNA熒光定量PCR操作流程
3.2.2 靶基因NOBl和SLC4Al檢測
3.2.3 靶基因NOBl和SLC4A1的蛋白表達(dá)水平檢測(Western blot)
3.2.4 免疫組織化學(xué)檢測NOBl蛋白表達(dá)
3.2.5 統(tǒng)計(jì)分析方法
3.3 結(jié)果
3.3.1 腎透明細(xì)胞癌中miR-646和NOBl的表達(dá)情況和單變量和多變量風(fēng)險(xiǎn)模型分析
3.3.2 不同級(jí)別腎透明細(xì)胞癌中NOBl的表達(dá)情況及其與臨床病理特征的關(guān)系
3.4 討論
3.5 結(jié)論
第4章 miR-646靶基因驗(yàn)證及其在腎透明細(xì)胞癌中的作用及機(jī)制研究
4.1 材料和儀器
4.1.1 細(xì)胞系及動(dòng)物模型
4.1.2 細(xì)胞培養(yǎng)基質(zhì)粒抽提相關(guān)試劑盒
4.1.3 實(shí)驗(yàn)主要儀器
4.2 方法
4.2.1 靶基因雙熒光素酶活性檢測
4.2.2 轉(zhuǎn)染后腎癌細(xì)胞系和293T細(xì)胞中miR-646和相關(guān)因的表達(dá)水平檢測
4.2.3 轉(zhuǎn)染miR-646后腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞增殖影響的檢測(MTT法)
4.2.4 轉(zhuǎn)染miR-646后腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞遷移的檢測(Wound healing法)
4.2.5 轉(zhuǎn)染miR-646后腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞凋亡的檢測(FACS)
4.2.6 轉(zhuǎn)染miR-646后腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞侵襲的檢測(Transwell小室)
4.2.7 血管生成實(shí)驗(yàn)(.Angiogenesis),體外條件下腎細(xì)胞癌細(xì)胞與HUVE(人臍帶血內(nèi)皮細(xì)胞)共培養(yǎng)檢測血管形成能力
4.2.8 蛋白質(zhì)芯片檢測miR-646對(duì)腎透明細(xì)胞癌細(xì)胞的下游靶基因及通路的相關(guān)蛋白表達(dá)變化
4.2.9 小鼠成瘤實(shí)驗(yàn)檢測miR-646和NOBl-shRNA對(duì)腎癌細(xì)胞裸鼠體內(nèi)成瘤性的影響
4.3 結(jié)果
4.3.1 786-0、ACHN和Caki-2腎癌細(xì)胞株中miR的表達(dá)水平
4.3.2 miR-646靶基因生物信息學(xué)預(yù)測
4.3.3 293-T細(xì)胞中miR-646靶向調(diào)控NOBl的雙熒光素酶活性的檢測
4.3.4 腎透明細(xì)胞癌中過表達(dá)或干擾miR-646后對(duì)靶基因NOBl基因和蛋白表達(dá)的影響
4.3.5 miR-646對(duì)腎癌細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期的影響
4.3.6 miR-646對(duì)腎癌細(xì)胞遷移和侵襲功能的影響
4.3.7 細(xì)胞克隆實(shí)驗(yàn)檢測miR-646對(duì)腎癌細(xì)胞增殖生長的影響
4.3.8 體外血管生成實(shí)驗(yàn)(Angiogenesis)檢測miR-646對(duì)腎癌細(xì)胞血管形成影響
4.3.9 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證體外細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn):miR-對(duì)腎癌細(xì)胞裸鼠成瘤性的影響
4.3.10 miR-646可直接靶向NOBl基因,間接影響SLC4A1基因的表達(dá)水平
4.3.11 miR-646靶向NOBl基因?qū)APK通路的調(diào)控機(jī)制
4.4 討論
4.5 小結(jié)
第5章 總結(jié)與展望
5.1 結(jié)論
5.2 進(jìn)一步工作的方向
參考文獻(xiàn)
后記
附錄綜述