前言
1 緒論
1.1 生物信息學的歷史
1.2 生物信息學的應用
1.3 生物信息學與其他學科的關系


2 生物數(shù)據(jù)庫介紹
2.1 序列數(shù)據(jù)庫
2.2 基因組數(shù)據(jù)庫
2.3 結構數(shù)據(jù)庫
2.4 功能數(shù)據(jù)庫
2.5 其他數(shù)據(jù)庫資源


3 序列比對
3.1 概述
3.2 序列比對的得分系統(tǒng)
3.3 兩條序列比對方法
3.4 多條序列比對方法


4 生物信息學常用概率統(tǒng)計學方法簡介
4.1 概述
4.2 序列對位顯著性檢驗
4.3 貝葉斯統(tǒng)計在序列對位中的應用


5 數(shù)據(jù)庫搜索
5.1 數(shù)據(jù)庫檢索
5.2 數(shù)據(jù)庫搜索相似序列
5.3 序列提交


6 分子系統(tǒng)發(fā)育分析
6.1 系統(tǒng)發(fā)育與系統(tǒng)發(fā)育樹
6.2 距離法
6.3 最大簡約法
6.4 極大似然法


7 基因組學與基因預測
7.1 引言
7.2 基因組測序技術及序列組裝
7.3 功能基因組學
7.4 比較基因組學


8 蛋白質結構與功能預測
8.1 蛋白質結構簡介
8.2 蛋白質三維結構分類及蛋白質家族
8.3 三維結構比對
8.4 蛋白質基本性質預測
8.5 蛋白質二級結構預測
8.6 蛋白質高級結構預測
8.7 蛋白質互作分析
8.8 藥物發(fā)現(xiàn)與設計


9 轉錄組與蛋白質組分析
9.1 轉錄組與基因芯片簡介
9.2 基因芯片數(shù)據(jù)采集與分析
9.3 蛋白質組簡介
9.4 雙向凝膠電泳數(shù)據(jù)分析
9.5 蛋白質質譜數(shù)據(jù)分析


10 Perl語言在生物信息學中的應用
10.1 Perl簡介
10.2 數(shù)據(jù)結構和程序控制
10.3 編寫生物信息學應用程序
10.4 BioPerl應用