《生命科學(xué)名著:基因組3》在前兩版的基礎(chǔ)上對原有內(nèi)容進行了大量的更新和擴充,并對部分章節(jié)和內(nèi)容進行了重排,使背景資料更充實,層次更清晰,行文更流暢。
《生命科學(xué)名著:基因組3》共包含四大部分內(nèi)容,分別為研究基因組、基因組結(jié)構(gòu)、基因組功能和基因組的復(fù)制及進化。
《生命科學(xué)名著:基因組3》以清新而簡明的寫作風(fēng)格將基因組學(xué)的概念、觀點和內(nèi)容與傳統(tǒng)的基因分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)研究方法相結(jié)合,為基因組作為生命藍(lán)圖所起的作用提供了全新的視角。
《生命科學(xué)名著:基因組3》內(nèi)容翔實,深入淺出,引人入勝,根據(jù)內(nèi)容需要采用大量圖表,形象而簡潔,是一部適合作為教材的基因組學(xué)讀物。
《生命科學(xué)名著:基因組3》非常適合作為生物、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)、林學(xué)等相關(guān)學(xué)科本科生和研究生的基因組學(xué)課程教材,也可供專業(yè)科技人員閱讀。
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導(dǎo)語_點評_推薦詞
從《基因組2》的出版到現(xiàn)在,四個激動人心的年頭已然過去。
不時有新完成的人類染色體序列被公布,黑猩猩基因組的測序也已經(jīng)完成。真核生物中部分或全部序列已明確的物種數(shù)目在迅猛增加,而且新的原核序列每周都在實時地更新著。轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的實驗技術(shù)為研究基因組表達(dá)提供了新的視點,同時系統(tǒng)生物學(xué)這一新學(xué)科正在把基因組研究與細(xì)胞生物化學(xué)聯(lián)系在一起。所有這些進展都已經(jīng)被加入到這本《基因組3》之中。特別是以前單獨一章的基因組結(jié)構(gòu)被分解成了三個章節(jié),而且,通過撰寫如何分析序列及如何研究轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組的獨立章節(jié),本書極大地豐富了后基因組學(xué)方面的材料。我也抓住時機,更加深入地描述了基因組的表達(dá)、復(fù)制和重組。
上述變化已經(jīng)使《基因組》一書篇幅增加不少,作為補償,我努力令這本書更便于使用,F(xiàn)在,技術(shù)注解只用于描述技術(shù)。這樣,正文作為一個整體就不那么零散,從而有了更加連續(xù)的敘述。插圖已經(jīng)徹底重新設(shè)計,圖表變得更加明了,更加引人人勝。閱讀條目和章節(jié)結(jié)尾處的習(xí)題也已進行了相應(yīng)全面的再評估。
在做這些修改的過程中,我已經(jīng)考慮到一些來自世界各地的教師和學(xué)生們的反饋。這些人不勝枚舉,我只好向大家一起道聲謝謝。有一個我要單獨感謝的人,他就是曼徹斯特大學(xué)的Daniela Delneri,他關(guān)于后基因組以及分子進化章節(jié)的注釋是如此全面,以致我自己幾乎不需要在這些領(lǐng)域再做任何調(diào)研了。我還非常感謝紐約州立大學(xué)Fredonia校區(qū)生物系的TedLee,他承擔(dān)了令人畏懼的(至少對我是如此)任務(wù),為書中每一章撰寫綜合問答及習(xí)題,這些學(xué)習(xí)輔助材料極大地提升了本書的價值。我還要感謝Garland Science出版社的Dominic Holdsworth和Jackie Harbor,他們在我準(zhǔn)備《基因組3》的過程中給予了巨大的支持。感謝Matthew McClements重新設(shè)計了精彩插圖。在第一版中我就寫過如果這本書對你有幫助,那就請你謝謝Keri,而不是謝謝我,因為是她促成了本書的完成,我很高興能有這樣的人促使我致力于本書的編寫。
目錄
譯者序
第三版前言
第二版前言
第一版前言
內(nèi)容介紹
縮略語
第1篇 研究基因組
第1章 基因組?轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組 3
1.1 DNA 5
1.2 RNA和轉(zhuǎn)錄組 14
1.3 蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)組 17
總結(jié) 24
第2章 研究DNA 30
2.1 用于DNA操作的酶 33
2.2 DNA克隆 44
2.3 聚合酶鏈反應(yīng)(PCR) 56
總結(jié) 59
第3章 基因組作圖 66
3.1 遺傳圖譜和物理圖譜 68
3.2 遺傳作圖 69
3.3 物理作圖 88
總結(jié) 101
第4章 基因組測序 107
4.1 DNA測序方法學(xué) 108
4.2 連續(xù)DNA序列的組裝 116
4.3 人類基因組計劃 125
總結(jié) 128
第5章 解讀基因組序列 134
5.1 在基因組序列中定位基因 135
5.2 確定單個基因的功能 147
5.3 個例研究: 標(biāo)注釀酒酵母基因組序列 160
總結(jié) 163
第6章 理解基因組是如何行使功能的 169
6.1 轉(zhuǎn)錄組研究 170
6.2 蛋白質(zhì)組研究 176
6.3 蛋白質(zhì)組之外 188
總結(jié) 190
第2篇 基因組結(jié)構(gòu)
第7章 真核生物核基因組 199
7.1 核基因組包含于染色體當(dāng)中 200
7.2 真核生物核基因組的遺傳特征 206
總結(jié) 221
第8章 原核生物基因組和真核生物細(xì)胞器基因組 227
8.1 原核生物基因組的物理特征 228
8.2 原核生物基因組的遺傳學(xué)特征 232
8.3 真核生物細(xì)胞器基因組 239
總結(jié) 243
第9章 病毒基因組和可移動的遺傳元件 249
9.1 噬菌體和真核生物病毒的基因組 250
9.2 可移動的遺傳元件 257
總結(jié) 264
第3篇 基因組如何行使功能
第10章 接近基因組 273
10.1 細(xì)胞核內(nèi)部 274
10.2 染色質(zhì)修飾和基因組表達(dá) 281
10.3 DNA修飾和基因組表達(dá) 287
總結(jié) 291
第11章 轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的組裝 297
11.1 DNA結(jié)合蛋白及其結(jié)合位點 299
11.2 轉(zhuǎn)錄起始中DNA唱蛋白質(zhì)的相互作用 310
11.3 轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控 317
總結(jié) 326
第12章 RNA的合成和加工 333
12.1 細(xì)菌RNA的合成和加工 334
12.2 真核細(xì)胞RNA的合成和加工 346
總結(jié) 373
第13章 蛋白質(zhì)組的合成與加工 381
13.1 tRNA在蛋白質(zhì)合成中的作用 382
13.2 核糖體在蛋白質(zhì)合成中的作用 388
13.3 蛋白質(zhì)翻譯后加工 401
13.4 蛋白質(zhì)降解 409
總結(jié) 410
第14章 基因組活性的調(diào)控 417
14.1 基因組活性的瞬時變化 419
14.2 基因組活性的永久性和半永久性變化 430
14.3 發(fā)育過程中基因組活性的調(diào)節(jié) 436
總結(jié) 448
第4篇 基因組如何復(fù)制及進化
第15章 基因組復(fù)制 457
15.1 拓?fù)鋵W(xué)問題 458
15.2 復(fù)制過程 464
15.3 真核生物基因組復(fù)制的調(diào)控 481
總結(jié) 486
第16章 突變和DNA修復(fù) 493
16.1 突變 494
16.2 DNA修復(fù) 510
總結(jié) 519
第17章 重組 526
17.1 同源重組 527
17.2 位點特異性重組 534
17.3 轉(zhuǎn)座 536
總結(jié) 540
第18章 基因組如何進化 546
18.1 基因組: 最初的100 億年 547
18.2 新基因的獲得 551
18.3 非編碼DNA與基因組進化 563
18.4 人類基因組: 最近的500 萬年 567
總結(jié) 568
第19章 分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué) 575
19.1 從分類學(xué)到分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué) 576
19.2 基于DNA的系統(tǒng)發(fā)生樹的重建 579
19.3 分子系統(tǒng)發(fā)生學(xué)的應(yīng)用 589
總結(jié) 598
附錄 604
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