第1章 核酸的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)
1.1 DNA的結(jié)構(gòu)
1.1.1 DNA的化學(xué)組成
1.1.2 DNA雙螺旋
1.1.3 DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性
1.2 DNA超螺旋
1.2.1超螺旋DNA
1.2.2共價(jià)閉合環(huán)狀DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)
1.2.3超螺旋密度
1.2.4拓?fù)洚悩?gòu)酶
1.2.5嵌入劑
1.3 DNA的變性和復(fù)性
1.3.1 DNA變性
1.3.2復(fù)性
1.4RNA結(jié)構(gòu)
第1章 核酸的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)
1.1 DNA的結(jié)構(gòu)
1.1.1 DNA的化學(xué)組成
1.1.2 DNA雙螺旋
1.1.3 DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性
1.2 DNA超螺旋
1.2.1超螺旋DNA
1.2.2共價(jià)閉合環(huán)狀DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)
1.2.3超螺旋密度
1.2.4拓?fù)洚悩?gòu)酶
1.2.5嵌入劑
1.3 DNA的變性和復(fù)性
1.3.1 DNA變性
1.3.2復(fù)性
1.4RNA結(jié)構(gòu)
第2章 基因組DNA
2.1原核生物的基因組和染色體
2.1.1原核生物基因組的遺傳結(jié)構(gòu)
2.1.2原核生物的染色體
2.2真核生物的基因組
2.2.1真核生物的C值矛盾與非編碼DNA
2.2.2真核生物基因組的序列組分
2.3真核生物的染色體和染色質(zhì)
2.3.1組蛋白
2.3.2核小體
2.3.3從核小體到中期染色體
2.3.4異染色質(zhì)與常染色質(zhì)
2.3.5真核生物染色體DNA上的幾個(gè)重要元件
2.4核外基因組
2.4.1質(zhì);蚪M
2.4.2線粒體基因組
2.4.3葉綠體基因組
第3章 DNA的復(fù)制
3.1 DNA復(fù)制的一般特征
3.1.1半保留復(fù)制
3.1.2復(fù)制起點(diǎn)與復(fù)制子
3.1.3 DNA合成的引發(fā)
3.1.4半不連續(xù)復(fù)制
3.1.5滾環(huán)復(fù)制與D環(huán)復(fù)制
3.2大腸桿菌染色體DNA的復(fù)制
3.2.1復(fù)制的起始
3.2.2復(fù)制的延伸
3.2.3復(fù)制的終止
3.2.4復(fù)制起始調(diào)控
3.3真核生物DNA復(fù)制
3.3.1 SV40 DNA的復(fù)制
3.3.2真核生物基因組復(fù)制的調(diào)控
3.3.3核小體的組裝
3.3.4端粒DNA復(fù)制
3.4反轉(zhuǎn)錄
3.4.1反轉(zhuǎn)錄病毒的結(jié)構(gòu)
3.4.2反轉(zhuǎn)錄病毒的基因組
3.4.3反轉(zhuǎn)錄過程
3.4.4原病毒DNA的整合
第4章 DNA的突變、損傷和修復(fù)
4.1 DNA突變
4.1.1突變的主要類型
4.1.2突變的產(chǎn)生
4.1.3正向突變、回復(fù)突變與突變的校正
4.1.4突變熱點(diǎn)
4.2 DNA修復(fù)
4.2.1光復(fù)活
4.2.2烷基的轉(zhuǎn)移
4.2.3核苷酸切除修復(fù)
4.2.4堿基切除修復(fù)
4.2.5錯(cuò)配修復(fù)
4.2.6極小補(bǔ)丁修復(fù)
4.2.7重組修復(fù)
4.2.8SOS反應(yīng)
4.2.9真核生物的DNA修復(fù)
第5章 DNA重組
5.1同源重組
5.1.1同源重組的分子模型
5.1.2大腸桿菌的同源重組
5.1.3真核細(xì)胞的同源重組
5.1.4交配型轉(zhuǎn)換
5.1.5基因轉(zhuǎn)換
5.2位點(diǎn)特異性重組
5.3轉(zhuǎn)座
5.3.1 DNA轉(zhuǎn)座子
5.3.2反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
5.3.3 Mu噬菌體
第6章 RNA的生物合成
6.1原核生物的轉(zhuǎn)錄機(jī)制
6.1.1大腸桿菌RNA聚合酶
6.1.2σ70啟動子
6.1.3原核生物的轉(zhuǎn)錄
6.2真核生物的轉(zhuǎn)錄機(jī)制
6.2.1真核生物RNA聚合酶
6.2.2 RNA Pol Ⅰ基因的轉(zhuǎn)錄
6.2.3 RNA Pol Ⅲ基因的轉(zhuǎn)錄
6.2.4 RNA Pol Ⅱ基因的轉(zhuǎn)錄
第7章 轉(zhuǎn)錄后加工
7.1真核生物前體mRNA的加工
7.1.15′端加帽
7.1.23′端加尾
7.1.3剪接
7.1.4 RNA編輯
7.1.5 RNA運(yùn)出細(xì)胞核
7.2 mRNA降解
7.2.1原核生物mRNA的降解
7.2.2真核生物mRNA的降解
7.3前體rRNA和前體tRNA的加工
7.3.1原核生物rRNA前體的加工
7.3.2真核生物rRNA前體的加工
7.3.3原核生物tRNA前體的加工
7.3.4真核生物tRNA前體的加工
7.4四種內(nèi)含子的比較
7.4.1細(xì)胞核前體mRNA的GUAG型內(nèi)含子
7.4.2Ⅰ型內(nèi)含子
7.4.3Ⅱ型內(nèi)含子
7.4.4真核生物前體tRNA內(nèi)含子
第8章 蛋白質(zhì)的生物合成
8.1遺傳密碼
8.1.1遺傳密碼是三聯(lián)體
8.1.2遺傳密碼的破譯
8.1.3密碼子的特性
8.2 tRNA
8.2.1 tRNA分子的二級結(jié)構(gòu)
8.2.2 tRNA分子的三級結(jié)構(gòu)
8.2.3密碼子和反密碼子的相互作用
8.3氨酰tRNA合成酶
8.3.1氨酰tRNA合成酶催化的化學(xué)反應(yīng)
8.3.2氨酰tRNA合成酶的分類
8.3.3氨酰tRNA合成酶對tRNA的識別
8.3.4氨酰tRNA合成酶的校正功能
8.4核糖體
8.4.1核糖體的結(jié)構(gòu)
8.4.2核糖體循環(huán)
8.4.3肽酰轉(zhuǎn)移酶反應(yīng)
8.5多肽鏈的合成
8.5.1原核生物多肽鏈的合成
8.5.2真核生物多肽鏈的合成
8.6反式翻譯
8.6.1 tmRNA的結(jié)構(gòu)與功能
8.6.2反式翻譯的分子模型
8.7程序性核糖體移碼
8.8硒代半胱氨酸
8.9吡咯賴氨酸
8.10依賴翻譯的mRNA質(zhì)量監(jiān)控
8.10.1無義密碼子介導(dǎo)的mRNA降解
8.10.2無終止密碼子介導(dǎo)的mRNA降解
8.11蛋白質(zhì)合成的抑制劑
8.12蛋白質(zhì)翻譯后加工
8.12.1蛋白質(zhì)的折疊
8.12.2蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾
8.12.3蛋白質(zhì)的酶解切割
8.12.4內(nèi)含肽與蛋白質(zhì)拼接
8.13蛋白質(zhì)的定向與分揀
8.13.1翻譯?轉(zhuǎn)運(yùn)途徑
8.13.2翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)途徑
8.14蛋白質(zhì)的降解
8.14.1溶酶體降解途徑
8.14.2泛素?蛋白酶體途徑
第9章 原核生物基因表達(dá)的調(diào)控
9.1轉(zhuǎn)錄水平的基因表達(dá)調(diào)控
9.1.1轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控
9.1.2轉(zhuǎn)錄終止階段的調(diào)控
9.2翻譯水平的調(diào)控
9.2.1反義RNA
9.2.2核糖體蛋白的自體控制
9.2.3一些mRNA分子必須經(jīng)過切割才能被翻譯
9.2.4嚴(yán)緊反應(yīng)
9.3核開關(guān)
9.4 DNA重排對基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控
9.5λ噬菌體調(diào)控級聯(lián)
9.5.1裂解周期中的級聯(lián)調(diào)控
9.5.2溶源生長的自體調(diào)控
9.5.3溶源生長建立的分子機(jī)制
9.5.4裂解生長和溶源生長的選擇
9.5.5前噬菌體的誘導(dǎo)
第10章 真核生物基因表達(dá)的調(diào)控
10.1染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)
10.1.1位置效應(yīng)
10.1.2活性染色質(zhì)的形態(tài)特征
10.1.3染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)節(jié)
10.1.4染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的區(qū)間性
10.2 DNA甲基化與基因組活性調(diào)控
10.2.1真核生物DNA的甲基化
10.2.2 DNA甲基化與基因沉默
10.2.3 DNA甲基化與基因組印記
10.2.4 X染色體失活
10.3真核生物的特異性轉(zhuǎn)錄因子
10.3.1轉(zhuǎn)錄因子的分離與鑒定
10.3.2轉(zhuǎn)錄因子的功能域
10.4轉(zhuǎn)錄因子的作用方式
10.4.1活化子
10.4.2抑制子
10.5轉(zhuǎn)錄因子活性的調(diào)節(jié)
10.5.1轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)調(diào)控
10.5.2信號分子對轉(zhuǎn)錄因子活性的調(diào)節(jié)
10.6轉(zhuǎn)錄后水平的基因表達(dá)調(diào)控
10.7翻譯水平的基因表達(dá)調(diào)控
10.7.1 mRNA結(jié)合蛋白對翻譯的調(diào)控
10.7.2翻譯激活因子對翻譯的激活作用
10.8 DNA重排與抗體基因的組裝
10.8.1抗體的分子結(jié)構(gòu)
10.8.2抗體基因的結(jié)構(gòu)及其重排
10.9 RNA介導(dǎo)的基因沉默
10.9.1 RNA干擾
10.9.2轉(zhuǎn)錄后基因沉默
10.9.3雙鏈RNA對基因組的調(diào)節(jié)
10.9.4微小RNA
第11章 分子生物學(xué)方法Ⅰ
11.1核酸的分離、純化、檢測和雜交
11.1.1 DNA的分離和純化
11.1.2 DNA凝膠電泳
11.1.3脈沖場凝膠電泳
11.1.4變性梯度凝膠電泳
11.1.5 DNA的化學(xué)合成
11.1.6完整基因的化學(xué)合成
11.1.7肽核酸
11.1.8用紫外線檢測DNA和RNA的濃度
11.1.9核酸的放射性標(biāo)記
11.1.10放射性標(biāo)記DNA的檢測
11.1.11 DNA和RNA的熒光檢測
11.1.12用生物素和地高辛標(biāo)記DNA
11.1.13Southern和Northern印跡雜交
11.1.14熒光原位雜交
11.1.15分子信標(biāo)
11.2基因克隆
11.2.1工具酶
11.2.2基因克隆的載體
11.2.3基因文庫
11.3聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
11.3.1 PCR簡介
11.3.2簡并引物
11.3.3反向PCR
11.3.4 PCR產(chǎn)物的克隆
11.3.5隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA
11.3.6反轉(zhuǎn)錄PCR
11.3.7差異顯示PCR
11.3.8快速cDNA末端擴(kuò)增
11.3.9定點(diǎn)突變
11.3.10 PCR介導(dǎo)產(chǎn)生融合基因
11.3.11實(shí)時(shí)熒光定量PCR
第12章 分子生物學(xué)方法Ⅱ
12.1 DNA測序和基因組測序
12.1.1 DNA測序
12.1.2基因組測序
12.2基因表達(dá)分析
12.2.1報(bào)告基因
12.2.2上游序列的缺失分析
12.2.3確定上游調(diào)控區(qū)中的蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)
12.2.4轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的確定
12.2.5轉(zhuǎn)錄組分析
12.3蛋白質(zhì)組學(xué)
12.3.1蛋白質(zhì)電泳
12.3.2雙向PAGE電泳
12.3.3蛋白質(zhì)Western印跡
12.3.4蛋白質(zhì)標(biāo)簽系統(tǒng)
12.3.5噬菌體展示
12.3.6酵母雙雜交系統(tǒng)
12.3.7免疫共沉淀
參考文獻(xiàn)