本書將分子動(dòng)力學(xué)理論與應(yīng)用相結(jié)合，以高質(zhì)量的代碼呈現(xiàn)分子動(dòng)力學(xué)模擬的底層邏輯與實(shí)現(xiàn)形式。內(nèi)容上，本書將在介紹分子動(dòng)力學(xué)模擬的經(jīng)典力學(xué)基礎(chǔ)、熱力學(xué)與經(jīng)典統(tǒng)計(jì)力學(xué)基礎(chǔ)之上，通過一個(gè)簡(jiǎn)單的分子動(dòng)力學(xué)模擬程序引導(dǎo)讀者從零構(gòu)建模擬程序。此后，再逐步上升到模擬的高階知識(shí)，如模擬盒子與近鄰列表、經(jīng)驗(yàn)勢(shì)函數(shù)與機(jī)器學(xué)習(xí)勢(shì)函數(shù)、控溫與控壓算法、平衡態(tài)性質(zhì)、輸運(yùn)性質(zhì)的計(jì)算、基于路徑積分的量子分子動(dòng)力學(xué)模擬等內(nèi)容。