《孝經鄭氏注箋釋》三卷并《孝經校釋》一卷，是曹元弼《孝經》學的代表作。曹氏先列經文，其后考注，再為箋釋。而其考注，有時錄鄭注他經之文以補全之。 與《孝經學》的略釋大義不同，《孝經鄭氏注箋釋》極盡精詳。在這本書中，他重構了《孝經》與六經的關系，并且以《孝經》學的愛敬之理貫穿、統(tǒng)攝六經，建構了一個新的經學體系。簡言之，就是以《孝經》會通六藝。曹元弼的種種努力，是為了重建在近代變革中被沖擊和瓦解的經學，構建起以人倫、愛敬為宗旨，以禮為體，六藝同條共貫之經學體系