《生物信息學(xué)分析實(shí)踐》內(nèi)容主要包括生物信息學(xué)簡(jiǎn)介、三大數(shù)據(jù)庫(kù)檢索、引物設(shè)計(jì)及測(cè)序結(jié)果分析、核酸序列分析、蛋白質(zhì)序列分析、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、系統(tǒng)發(fā)育分析、RNA分析、參考文獻(xiàn)管理。《生物信息學(xué)分析實(shí)踐》的一大特色在于豐富的實(shí)例和圖表，使讀者可以很直觀地了解和掌握書(shū)中的內(nèi)容。
《生物信息學(xué)分析實(shí)踐》取材新穎，實(shí)踐性強(qiáng)，是一本實(shí)用的生物信息學(xué)分析手冊(cè)與操作指南，適用于生命科學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等相關(guān)專業(yè)學(xué)生使用，也可用于從事生物學(xué)相關(guān)的科研人員、教師參考使用。
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寫法特點(diǎn)：原理、方法、操作相結(jié)合，從基礎(chǔ)理論出發(fā)，循序漸進(jìn)，以漸進(jìn)式實(shí)例引導(dǎo)讀者學(xué)習(xí)，適時(shí)闡述文中要點(diǎn)，讓讀者在實(shí)例中鞏固理論基礎(chǔ)。實(shí)例特點(diǎn)：實(shí)例取材自科研第一線背景的素材，實(shí)踐性強(qiáng)，覆蓋面廣，讓讀者在實(shí)例分析的過(guò)程中，不僅學(xué)會(huì)工具軟件的操作使用，更能學(xué)會(huì)思考與解決問(wèn)題。操作演示：漸進(jìn)式的實(shí)例演示，圖文并茂，簡(jiǎn)單易學(xué)，花幾分鐘即可學(xué)會(huì)一個(gè)實(shí)例。對(duì)于生物信息學(xué)初學(xué)者或從事生命科學(xué)領(lǐng)域的科研工作者具有一定的指導(dǎo)意義。
隨著計(jì)算機(jī)科學(xué)、信息科學(xué)等飛速發(fā)展，一門以數(shù)據(jù)分析處理為本質(zhì)的新學(xué)科——生物信息學(xué)悄然興起，它融合了數(shù)學(xué)、生命科學(xué)、計(jì)算機(jī)信息科學(xué)等多門學(xué)科，至今已經(jīng)廣泛地滲透到科學(xué)研究的各個(gè)方面，成為一門用途極為廣泛的工具學(xué)科。核酸序列、蛋白質(zhì)序列的分析，以及各類生物學(xué)軟件和數(shù)據(jù)庫(kù)的應(yīng)用，已經(jīng)成為科研作者必備的基本技能。然而，由于擅長(zhǎng)專業(yè)領(lǐng)域的不同，研究人員面對(duì)大量的生物學(xué)軟件及數(shù)據(jù)庫(kù)常無(wú)所適從。目前國(guó)內(nèi)外已有不少優(yōu)秀的生物信息學(xué)教材與專著，但大多數(shù)以理論為主，或側(cè)重于算法研究，或傾向于網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)介紹，對(duì)于數(shù)據(jù)實(shí)例分析實(shí)踐的專著尚不多見(jiàn)。為此，本書(shū)編寫的目的就是為不同專業(yè)背景的讀者提供一本實(shí)用的生物信息學(xué)分析入門書(shū)，讓讀者在實(shí)例分析的過(guò)程中，不僅學(xué)會(huì)工具軟件的操作使用，更能學(xué)會(huì)思考與解決科研問(wèn)題。
2008年夏，在福建農(nóng)林大學(xué)植物病毒研究所的倡議下，編著者通過(guò)基因酷等論壇，向在生物信息學(xué)及相關(guān)領(lǐng)域教學(xué)與科研第一線的人員發(fā)出邀請(qǐng)，希望他們加入《生物信息學(xué)分析實(shí)踐》編委會(huì)，共同編寫本書(shū)。很快，中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所喬楠和劉林川、中國(guó)科學(xué)院南京地質(zhì)古生物研究所蓋永華、南京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李鵬、西北農(nóng)林科技大學(xué)林文超、福建省出入境檢驗(yàn)檢疫局沈建國(guó)、浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院鹿連明、南方醫(yī)科大學(xué)郭玲等欣然同意共同編寫本書(shū)。本書(shū)由吳祖建、高芳鑾、沈建國(guó)擔(dān)任主編。
人類基因組計(jì)劃的目的是解碼生命、了解生命的起源、了解生命體生長(zhǎng)發(fā)育的規(guī)律、認(rèn)識(shí)種屬之間和個(gè)體之間存在差異的起因、認(rèn)識(shí)疾病產(chǎn)生的機(jī)制以及長(zhǎng)壽與衰老等生命現(xiàn)象、為疾病的診治提供科學(xué)依據(jù)。人類基因組計(jì)劃的完成，為人類生命科學(xué)開(kāi)辟了一個(gè)新紀(jì)元，它對(duì)生命本質(zhì)、人類進(jìn)化、生物遺傳、個(gè)體差異、發(fā)病機(jī)制、疾病防治、新藥開(kāi)發(fā)、健康長(zhǎng)壽等領(lǐng)域，以及對(duì)整個(gè)生物學(xué)都具有深遠(yuǎn)的影響和重大的意義，標(biāo)志著人類生命科學(xué)一個(gè)新時(shí)代的來(lái)臨。2.人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃事實(shí)上，HGP的正式完成只意味著邁出了萬(wàn)里長(zhǎng)征的第一步，僅僅測(cè)繪出基因組序列并非這一計(jì)劃的最終目的，也并不能解決困擾生物學(xué)家的所有難題。要想進(jìn)一步了解生物世界的更多信息就必須對(duì)基因編碼產(chǎn)物——蛋白質(zhì)進(jìn)行系統(tǒng)深入的研究。針對(duì)這一重大的科學(xué)命題，多國(guó)科學(xué)家共同組織啟動(dòng)了人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃（human proteome project，HPP）。早在20世紀(jì)90年代中期人類基因組計(jì)劃成形時(shí)，就有研究人員考慮過(guò)人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃，但由于蛋白質(zhì)組的規(guī)模和復(fù)雜性而一直沒(méi)能實(shí)現(xiàn)。隨著基因大規(guī)模測(cè)序的結(jié)束，科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)編碼基因比估計(jì)數(shù)量大大減少。過(guò)去預(yù)測(cè)的數(shù)量是5萬(wàn)～10萬(wàn)個(gè)，而現(xiàn)在認(rèn)為只有約2.1 萬(wàn)個(gè)，這使得人類蛋白質(zhì)組的規(guī)模變得更容易處理�；蚪M計(jì)劃中所積累的技術(shù)方法與合作體系也使得蛋白質(zhì)組計(jì)劃得以實(shí)現(xiàn)，這是繼國(guó)際人類基因組計(jì)劃之后的又一項(xiàng)大規(guī)模的國(guó)際性科技工程，無(wú)論在科學(xué)目標(biāo)、研究策略、技術(shù)體系，還是在跨國(guó)組織、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)整合分析等方面，均較人類基因組計(jì)劃更具挑戰(zhàn)性和復(fù)雜性。首批行動(dòng)計(jì)劃包括中國(guó)科學(xué)家牽頭的“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”和美國(guó)科學(xué)家牽頭的“人類血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃”。由于中國(guó)在蛋白質(zhì)研究方面的雄厚實(shí)力，HPP將總部設(shè)在中國(guó)北京，其中“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”由中國(guó)科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)執(zhí)行，這是我國(guó)科學(xué)家第一次領(lǐng)導(dǎo)執(zhí)行重大國(guó)際科技協(xié)作計(jì)劃。
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