《中國科學院院屬單位簡史（第2卷）（套裝上下冊）》首次系統(tǒng)、全面梳理了60年來中國科學院院屬單位的發(fā)展歷程，以檔案文獻和當事人的親歷資料等為基礎，記錄了院屬科研、公共支撐和公司企業(yè)等單位的概況、機構沿革、科研方向的發(fā)展演變、重要科研成果、人才教育和創(chuàng)新文化建設等各方面的發(fā)展情況及其對中國科學發(fā)展的貢獻。全書附有大量的統(tǒng)計數據，學術性與資料性兼具。《中國科學院院屬單位簡史（第2卷）（套裝上下冊）》既可作為廣大科研人員、科技管理工作者、科技史學者、歷史學者等專業(yè)人員的案頭必備工具，也可供對中國當代史、當代科技史感興趣的讀者參閱。
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中國科學院自1949年建院以來，已經從建院初期的第一批10多個研究機構發(fā)展為至今包括99個研究院所、22個其他院直屬事業(yè)單位和23家院投資控股企業(yè)等院屬單位組成的規(guī)模宏大的國家科學院。60年來，院屬機構隨著國家工農業(yè)和國防建設的需要和科學技術的發(fā)展而成長壯大，也受到了劇烈的社會變革的沖擊和影響，不斷變化和調整。各單位的發(fā)展史，構成了中國科學院發(fā)展史的重要篇章。
從籌劃“中國科學院院史叢書”一開始，院屬單位史志的編撰就納入了工作計劃。為了推動院屬單位史志編撰工作，2006年底，“中國科學院院史研究與編撰”課題組在中國科學院院史工作委員會的支持下，對全院①的史志工作進行了摸底調查。在此基礎上，于2007年7月在北京召開了中國科學院史志工作研討會。這一會議是中國科學院召開的首次史志工作研討會，50多個院屬單位的代表參加了會議。會議期間，與會者交流了單位史志編撰工作的經驗，一致認為：近年來中國科學院史志工作得到較大的發(fā)展，令人振奮。單位史志是“中國科學院院史叢書”的重要組成部分，要把單位史志與院史工作結合起來，自上而下和自下而上相結合，充分調動各單位的積極性，把比較成熟的史志納入“中國科學院院史叢書”。與會者建議在“中國科學院院史叢書”中增加一部包括各研究所簡史的《中國科學院院屬單位簡史》。
史志工作研討會后，課題組立即著手這項工作，并于2007年7月通過院辦公廳向院屬所有單位發(fā)出了編撰各單位簡史的通知，就撰寫要求和有關事項做了簡要說明。擬議中的《中國科學院院屬單位簡史》擬由分院、院直屬事業(yè)單位、學校及公共支撐單位、共建單位等單位簡史組成，各單位簡史一般以控制在兩萬字以內為宜，其基本內容包括單位的機構沿革、學科方向和科研工作的發(fā)展演變、重要科技成果、人才培養(yǎng)，以及知識創(chuàng)新工程實施以來的發(fā)展近況和現狀等，并初步確定截稿日期為2008年7月。
第二卷（上冊）
前言
中國科學院上海分院
中國科學院上海微系統(tǒng)與信息技術研究所
中國科學院上海光學精密機械研究所
中國科學院上海硅酸鹽研究所
中國科學院上海有機化學研究所
中國科學院上海天文臺
中國科學院上海生命科學研究院
中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所
原中國科學院上海生物化學研究所
原中國科學院上海細胞生物學研究所
中國科學院神經科學研究所
原中國科學院上海腦研究所
中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態(tài)研究所
原中國科學院上海植物生理研究所
原中國科學院上海昆蟲研究所
中國科學院上海生命科學研究院／上海交通大學醫(yī)學院健康科學研究所
中國科學院上海生命科學研究院營養(yǎng)科學研究所
中國科學院上海巴斯德研究所（籌）
中國科學院·馬普學會計算生物學伙伴研究所
中國科學院上海生命科學信息中心
原中國科學院上海文獻情報中心
中國科學院上海交叉學科研究中心
上海中科伍佰豪生物工程有限公司
原中國科學院上海生物工程研究中心
中國科學院上海實驗動物中心
原中國科學院上海生理研究所
中國科學院上海藥物研究所
中國科學院南京分院
中國科學院南京地質古生物所
中國科學院南京土壤研究所
中國科學院南京地理與湖泊研究所
中國科學院合肥物質科學研究院
中國科學院安徽光學精密機械研究所
中國科學院等離子體物理研究所
中國科學院固體物理研究所
中國科學院合肥智能機械研究所
原中國科學院合肥分院
中國科學院武漢巖土力學研究所
中國科學院武漢物理與數學研究所
中國科學院武漢病毒研究所
中國科學院測量與地球物理研究所
中國科學院水生生物研究所
第二卷（下冊）
中國科學院武漢植物園
中國科學院廣州分院
中國科學院南海海洋研究所
中國科學院華南植物園
中國科學院廣州能源研究所
原中國科學院廣州人造衛(wèi)星觀測站
中國科學院廣州地球化學研究所
中國科學院亞熱帶農業(yè)生態(tài)研究所
中國科學院成都分院
中國科學院成都生物研究所
中國科學院·水利部成都山地災害與環(huán)境研究所
中國科學院光電技術研究所
中國科學院昆明動物研究所
中國科學院昆明植物研究所
中國科學院西雙版納熱帶植物園
中國科學院地球化學研究所
中國科學院西安分院
中國科學院西安光學精密機械研究所
中國科學院地球環(huán)境研究所
中國科學院蘭州分院
中國科學院近代物理研究所
中國科學院蘭州化學物理研究所
中國科學院寒區(qū)旱區(qū)環(huán)境與工程研究所
中國科學院青海鹽湖研究所
中國科學院西北高原生物研究所
中國科學院新疆分院
中國科學院新疆理化技術研究所
中國科學院·水利部水土保持研究所
中國科學院研究生院
中國科學技術大學
中國科學院國家科學圖書館
科學時報社
科學出版社
中國科學院行政管理局
中國科學院國有資產經營有限責任公司
東方科學儀器進出口集團有限公司
國科光電科技有限責任公司
中國科學院廣州化學有限公司（中國科學院廣州化學研究所）
中國科學院建筑設計研究院
北京中科資源有限公司
中國科學院沈陽計算技術研究所
中國科學院沈陽科學儀器研制中心有限公司
中國科學院成都有機化學有限公司（中國科學院成都有機化學研究所）
中國科技產業(yè)投資管理有限公司
1966年5月，“文化大革命”開始了，給全黨、全國人民帶來了深重災難，也給中國科學院華東分院造成了嚴重破壞，使科研和管理工作受到了巨大沖擊。
1966年下半年，受“紅衛(wèi)兵”運動的影響，華東分院及各研究所相繼出現了所謂的“革命造反組織”。1967年1月，在上海反革命“一月風暴”的推動下，分院系統(tǒng)的“造反派”非法奪取華東分院黨政領導權，1967年12月成立了中國科學院華東分院“革委會”（籌），造成華東分院黨委工作的全面癱瘓。
隨后，在開展“抓叛徒”、“清理階級隊伍”、“清查五·一六分子”及“一打三反”等階段中，制造了大量的冤、假、錯案，非正常死亡的人數高達79人。其中最為突出的是所謂“‘兩線一會’特務集團”的大冤案（“兩線”一是指日偽時期的上海自然科學研究所，二是指國民黨時期的中央研究院；“一會”是指解放前夕，上海各單位為反對遷臺而組織的護所、護校、迎解放的“應變會”），涉及分院系統(tǒng)14個單位，受到迫害、株連的達639人，有244人遭到毆打，其中2人被打致死、4人被迫自殺身亡。一些老科學家、老工作人員被打成“線上人”、“會中人”，或被誣陷為“特務”、“間諜”、“反動學術權威”，被揪斗、隔離審查�！岸�、批、改”和“四個面向”下達后，大批干部和科技人員被下放到“五·七”干校、工廠、農村和邊疆勞動。
1970年5月開始，經國務院批準，中國科學院對上海地區(qū)單位進行體制調整。
一是將華東昆蟲所、生理所、植物生理所、實驗生物所、生物實驗中心、藥物所、上海新滬玻璃廠、復旦大學光源室、中國科學器材公司上海分公司9個單位移交上海市。
二是對上海光機所、有機所、硅酸鹽所、冶金所、華東技術物理所、上海天文臺、生物化學所7個單位實行中國科學院歸口、地方為主的雙重領導。實行雙重領導的單位，承擔的國防、國民經濟重大任務不變。中國科學院除協助地方做好思想政治工作外，凡國防和重大的國民經濟方面的科研任務，由中國科學院通過市“革委會”下達；經費、器材由中國科學院歸口，列入國家計劃；黨政領導、編制定員、人事關系、業(yè)務領導以及抓革命、促生產等方面的工作由上海市“革委會”統(tǒng)一領導，地方在保證完成國家計劃的前提下，可以根據本地需要，向各單位安排其他科研任務。
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