近些年,數(shù)學(xué)方法在生物學(xué)和生命科學(xué)的研究中獲得了越來越廣泛的應(yīng)用.作為這方面的探索之一,本書旨在介紹變分方法在生物學(xué),特別是在細胞生物學(xué)中的應(yīng)用.內(nèi)容主要由以下三部分組成: 變分方法基本內(nèi)容介紹、圖像處理變分方法及其在細胞生長演化中的應(yīng)用介紹、變分方法在綠藻細胞分裂和細胞成形過程中的應(yīng)用介紹.
本書可供數(shù)學(xué)和生物學(xué)相關(guān)專業(yè)的高年級本科生和研究生以及相關(guān)行業(yè)科技工作者參考.
在生物學(xué)和生命科學(xué)的研究中,一個重要的研究方向就是細胞生物學(xué),這個學(xué)科重在研究細胞生命活動規(guī)律及其機制,主要在分子、細胞、組織和個體水平進行研究,探索體內(nèi)環(huán)境中細胞的結(jié)構(gòu)、功能、表型及其調(diào)控機制,通過各類技術(shù)和方法的使用,闡明生物體表型和功能異常產(chǎn)生的細胞生物學(xué)機制。
在2019年10月國家自然科學(xué)基金委員會以植物發(fā)育可塑性的細胞生物學(xué)基礎(chǔ)為主題的雙清論壇上,各類報告涉及生物學(xué)、化學(xué)、數(shù)學(xué)和物理學(xué)等多個學(xué)科。與會專家學(xué)者提出該領(lǐng)域亟待解決的重要基礎(chǔ)科學(xué)問題和急需發(fā)展的先進技術(shù),包括重點研究細胞壁等細胞發(fā)育可塑性的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),著眼于從細胞的分裂和形變理解植物器官的三維形態(tài)建立,以及建立適用于植物研究的高精度細胞結(jié)構(gòu)解析技術(shù)等。細胞作為生物體的構(gòu)成單位,在生物體的生命周期過程中不斷生長、分裂,再生長和分裂,如此循環(huán)往復(fù),直至周期結(jié)束。生物的多樣性決定了細胞生長和演化形式的多樣性,通常是生命形式越復(fù)雜,其細胞的演化過程也就越復(fù)雜,這給研究細胞演化機制和機理帶來困難。
實驗研究是一種借助于各種各樣的儀器對實驗室或環(huán)境中的各種生命體進行研究的基本方法,也是較為直觀的方法。而從實驗上升而來的理論不斷提升著人類對生命基本原理的理解和認識。在理論化的過程中,數(shù)學(xué)方法的引入和使用對生物學(xué)的研究起到重要作用。通常所說的生物數(shù)學(xué)包括生物學(xué)的數(shù)學(xué)模型和數(shù)學(xué)方法,涵蓋統(tǒng)計學(xué)的概率與隨機過程、微分方程(含偏微分方程)建模和分析、信息學(xué),以及系統(tǒng)論和控制論等。在實驗研究中使用較多的通常是與統(tǒng)計分析相關(guān)的理論,而微分方程建模研究一般多見于宏觀層面,例如種群的發(fā)展與衰亡,而隨著圖像技術(shù)發(fā)展,其在生物學(xué)特別是在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用也蓬勃發(fā)展起來,誕生了諸如生物和醫(yī)學(xué)圖像學(xué)(即影像學(xué))等學(xué)科。
本書的內(nèi)容是作者近年來完成的一些關(guān)于生物學(xué)方面細胞分裂機理的探索性成果。為了讀者閱讀方便起見,本書在寫作上盡量考慮了內(nèi)容的完整性,除了對變分學(xué)相關(guān)理論內(nèi)容介紹之外,主要還有兩部分內(nèi)容,一部分是基于圖像方法的細胞分裂和演化機制分析,另一部分是基于生物本能性質(zhì)的細胞分裂或演化機制分析,這兩部分共同的理論基礎(chǔ)就是變分原理,或者稱為變分法,變分法理論在17世紀(jì)末出現(xiàn)之后迅速發(fā)展起來,它除了在數(shù)學(xué)相關(guān)學(xué)科得以廣泛應(yīng)用之外,在力學(xué)、物理學(xué)、經(jīng)濟學(xué)、信息論、控制論,以及現(xiàn)在迅速發(fā)展的數(shù)字圖像處理技術(shù)和信息技術(shù)諸方面都獲得了較為深刻的應(yīng)用。
第1章 參數(shù)方程
1.1 曲面和曲線的參數(shù)方程表示
1.2 函數(shù)極值問題
1.3 一些輔助命題介紹
第2章 變分原理介紹
2.1 變分問題經(jīng)典實例
2.2 變分思想介紹
2.3 平面曲線變分問題舉例
2.4 二維變分原理在元器件散熱方面的應(yīng)用
第3章 基于圖像的細胞生長演化建模
3.1 關(guān)于圖像處理的總體介紹
3.2 圖像處理技術(shù)介紹去噪
3.3 圖像分割的基本方法介紹
3.4 圖像放大的擴散方程方法
3.5 圖像修復(fù)的變分法模型
3.6 細胞生長演化的圖像模擬建模
第4章 隔欄問題與鞘毛藻細胞分裂模型
4.1 問題背景介紹
4.2 鞘毛藻細胞分裂問題介紹
4.3 參數(shù)方程形式下的分裂模型
4.4 幾何實驗算例
4.5 鞘毛藻細胞分裂實驗
4.6 模型增長模擬
第5章 非標(biāo)準(zhǔn)分裂的鞘毛藻細胞模型分析
5.1 問題介紹
5.2 非標(biāo)準(zhǔn)分裂模型
5.3 固定邊界形狀的影響分析
5.4 分裂模擬
5.5 生長分裂過程模擬回顧
第6章 鞘毛藻非標(biāo)準(zhǔn)分裂細胞邊緣形成機理分析
6.1 細胞的非標(biāo)準(zhǔn)分裂的外部邊界的形狀建模
6.2 活動端點位置的數(shù)值求解與分析
第7章 盤星藻細胞模型分析
7.1 方程模型
7.2 生長過程的數(shù)值模擬
7.3 實驗
7.4 盤星藻細胞模型數(shù)據(jù)比較
……
第8章 帶權(quán)泡泡模型
附錄
參考文獻
索引