章 Julia 語言使用說明

第二章 系譜數(shù)據(jù)處理方法 .

節(jié)、近交系數(shù)與親緣系數(shù) .

第二節(jié) 分子血緣相關(guān)矩陣及其逆矩陣計算....

第三節(jié)、計算實例

第三章動物遺傳育種中的數(shù)據(jù)模擬 .........

節(jié)隨機數(shù)和隨機變量的產(chǎn)生

第二節(jié) 誤差計算...

第三節(jié) 使用 Julia 語言模擬數(shù)據(jù)..

第四節(jié) 計算實例 ...

第五節(jié) 基因組模擬軟件 XSim，

第四章，線性模型的建立和求解，

節(jié)，單因子模型 .....

第二節(jié)二因子模型 .........

第三節(jié)建立 Henderson 混合模型方程組 .

.第四節(jié)稀疏矩陣使用 ....

第五章 線性模型的擴展

節(jié)有重復(fù)記錄的動物模型.....

第二節(jié)母體效應(yīng)模型，

第六章多性狀模型優(yōu)勢

節(jié) 多性狀模型 ...

第二節(jié)Julia 語言實現(xiàn) MT 模型

第三節(jié) 帶有缺失數(shù)據(jù)的多性狀模型

第七章 分子標記和多基因效應(yīng)單性狀模型

節(jié) 標記輔助選擇..

第二節(jié)混合模型方程組的儲存技術(shù)

第三節(jié)Julia 語言示例 .....

第八章MCMC 算法

節(jié)貝葉斯統(tǒng)計....

第二節(jié)Julia 語言的實現(xiàn)....

第三節(jié)貝葉斯統(tǒng)計在多元線性模型中的應(yīng)用

第四節(jié)貝葉斯統(tǒng)計示例.....

第五節(jié) 多性狀模型的 Gibbs 抽樣，

第六節(jié) 思考題解答 ......

第九章全基因組連鎖及關(guān)聯(lián)分析

節(jié)考慮稀有變異非加性效應(yīng)的基因組分析

第二節(jié) 多元混合線性模型...

第三節(jié) 貝葉斯 GWAS

第四節(jié) 單步全基因組分析方法

第五節(jié) GBLUP 的準確性

第六節(jié) Julia 語言示例.

第十章附 錄 ..

1節(jié)線性模型簡介 .

第二節(jié)基于系譜的混合線性模型

第三節(jié)預(yù)測 SNP 效應(yīng)的固定效應(yīng)模型.

第四節(jié) 結(jié)合有基因型和無基因型家畜數(shù)據(jù)

第五節(jié) 貝葉斯 GWAS ..

第六節(jié) 統(tǒng)計基因組學(xué)基礎(chǔ)

第七節(jié)J Julia 和 R 語言混合編程解決稀有變異關(guān)聯(lián)研究問題

參考文獻