二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學(xué)習(xí)預(yù)測方法研究
定 價:68 元
叢書名:專著單本
- 作者:譚生龍
- 出版時間:2021/2/24
- ISBN:9787568921817
- 出 版 社:重慶大學(xué)出版社
- 中圖法分類:Q949.71
- 頁碼:
- 紙張:膠版紙
- 版次:1
- 開本:16K
本文詳細(xì)分析了模式植物二穗短柄草中抗病基因家族NBS-LRR的特征, 研究了怎樣從其全基因序列中鑒定抗病基因家族及各基因家族內(nèi)成員的特征, 并詳細(xì)分析了這些抗病基因亞類型、結(jié)構(gòu)域、進(jìn)化信息、染色體定位等眾多序列特征, 然后根據(jù)這些序列特征, 研究了從這些抗病基因序列中抽取離散特征向量的方法, 并應(yīng)用不同的機器學(xué)習(xí)方法對NBS-LRR抗病基因家族進(jìn)行模型構(gòu)建, 并選擇支持向量機作為一種機器學(xué)習(xí)模型進(jìn)行模型參數(shù)選擇和參數(shù)優(yōu)化方法, 最后研究了應(yīng)用構(gòu)建好的預(yù)測模型對其它經(jīng)濟作物全基因組序列進(jìn)行抗病基因的預(yù)測、抗病基因的注釋和分類的一站式分析平臺的構(gòu)建方法。
1 緒論
1.1 植物抗病基因概述
1.2 植物抗病基因研究中的生物信息學(xué)
1.3 常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析軟件
1.4 本書的技術(shù)線路圖
1.5 本書的主要內(nèi)容
1.6 本書的目的和意義
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鑒定與生物信息學(xué)
分析
2.1 引言及研究動機
2.2 數(shù)據(jù)與方法
2.3 結(jié)果與分析
2.4 討論與小結(jié)
3 二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表達(dá)譜分析
3.1 引言及研究動機
3.2 基因表達(dá)譜分析的常用技術(shù)
3.3 實驗數(shù)據(jù)的獲取
3.4 結(jié)果與分析
3.5 討論與小結(jié)
4 NBS—LRR基因家族預(yù)測算法的設(shè)計與應(yīng)用
4.1 研究背景
4.2 方法與數(shù)據(jù)集
4.3 結(jié)果與分析
5結(jié)與展望
5.1 主要研究結(jié)果
5.2 創(chuàng)新點
5.3 展望
附錄
附錄l 縮略詞簡表
附錄2 NBS—LRR抗病基因列表
附錄3 二穗短柄們鑒定出的126個典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
附錄4 NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
附錄5 氨基酸的部分理化性質(zhì)簡表
附錄6 擬南芥中的正負(fù)樣本序列列表
附錄7 NBS—LRR抗病基因的蛋白序列結(jié)構(gòu)域特征
參考文獻(xiàn)