本書主要介紹分子標記的類型、DNA分子標記的技術類型和指紋圖譜及其在椰子種質資源評價和椰子分子輔助育種方面的應用研究,并介紹了世界范圍內椰子育種的研究概況,以期向讀者展示椰子分子標記和DNA指紋及應用現狀、發(fā)展趨勢。
隨著我國椰子產業(yè)的不斷發(fā)展,椰子產業(yè)的科技創(chuàng)新能力得到不斷提升。但是長期以來,我國椰子產業(yè)發(fā)展過程中仍存在種質資源發(fā)掘、保存與創(chuàng)新利用不夠,缺乏有效便捷的評價手段,新品種繁育周期長,優(yōu)質育種材料缺乏等問題。當前,優(yōu)良品種的稀缺是限制椰子產業(yè)規(guī);闹饕蛩亍R邮嵌嗄晟魑,種果少繁育周期長,常規(guī)的育種技術已不能滿足當前產業(yè)發(fā)展的需求,分子輔助篩選成為椰子優(yōu)良品系繁育的重大機遇。椰子指紋圖譜技術對椰子產業(yè)的發(fā)展具有重要的意義,將有利于椰子新品種的登記及保護工作的開展,有利于椰子苗種的品種純度的鑒定及開發(fā)一套高效早期篩選去雜的方法,有利于椰子定向培育工作的開展并縮短椰子的育種周期。為了適應我國椰子種業(yè)的發(fā)展,為椰子研究人員提供參考,中國熱帶農業(yè)科學院椰子研究所組織科技人員編寫了《椰子分子標記和DNA指紋及應用》一書。本書主要介紹分子標記的類型、DNA分子標記的技術類型及其指紋圖譜及其在椰子種質資源評價和椰子分子輔助育種方面的應用研究,并介紹了世界范圍內椰子育種研究概況,使讀者能夠了解世界及我國椰子分子標記和DNA指紋及應用現狀及發(fā)展趨勢,為椰子種業(yè)的發(fā)展提供參考。
楊耀東,福建廈門人,德國海德堡大學植物分子與細胞生物學專業(yè)博士,在美國從事研究工作多年,現為中國熱帶農業(yè)科學院椰子研究所研究員。主要從事椰子、油棕等熱帶油料作物重要農藝性狀的解析、分子標記的開發(fā)、作物指紋圖譜的構建和分子輔助育種技術等研究工作。近年主持國家基金面上項目等各類科研項目18項,發(fā)表SCI論文39篇,其他論文36篇,獲授權中國發(fā)明專利2項,外國專利1項,軟件著作權2項,獲海南省科技進步三等獎一項。是FAO熱帶作物培訓專家?guī)烊霂鞂<、亞太地區(qū)椰子產業(yè)發(fā)展高級專家咨詢組成員和國際椰子基因組專題行動組的骨干成員。
第一章 椰子概況
第一節(jié) 世界椰子概況
一、椰子的起源
二、椰子的歷史
三、世界椰子的分布
四、全球椰子的種植面積與產量
第二節(jié) 中國椰子概況
一、中國椰子分布及產量
二、中國椰子種質資源收集
參考文獻
第二章 分子標記和DNA指紋圖譜概述
第一節(jié) 分子標記的產生
一、可變重復序列
二、DNA指紋圖譜
第二節(jié) 遺傳學標記的類型及其發(fā)展
一、形態(tài)學標記
二、細胞學標記
三、生物化學標記
四、免疫學標記
五、分子標記
第三節(jié) DNA指紋圖譜的特點
一、DNA指紋圖譜的基本特點
二、DNA分子標記的優(yōu)點
三、DNA分子標記的要求
第四節(jié) DNA指紋圖譜應用
一、法醫(yī)學
二、動植物科學
三、流行病學
參考文獻
第三章 DNA分子標記的技術類型
第一節(jié) DNA分子標記技術分類
一、根據檢測手段及相關技術分類
二、新型分類方法
第二節(jié) 常見的DNA分子標記技術
一、限制性片段長度多態(tài)性
二、單鏈構象多態(tài)性
三、變性梯度凝膠電泳
四、原位雜交
五、序列標記位點
六、隨機擴增多態(tài)性DNA
七、隨機引物
八、DNA擴增指紋技術
九、擴增的限制性內切酶片段長度多態(tài)性
十、簡單序列重復
十一、簡單重復序列間區(qū)
十二、逆轉錄PCR
十三、差異顯示逆轉錄PCR
十四、表達序列標簽
十五、單核苷酸多態(tài)性
第三節(jié) 新型的DNA分子標記技術
一、抗病基因同源序列
二、隨機微衛(wèi)星擴增多態(tài)
三、相關序列擴增多態(tài)性
四、靶位區(qū)域擴增多態(tài)性
五、酶切擴增多態(tài)性序列
六、序列特定擴增區(qū)域標記
七、限制性位點擴增多態(tài)性
第四節(jié) 新技術在分子標記開發(fā)的應用
一、構建遺傳圖譜
二、定位基因
三、種質鑒定和遺傳背景的分析
四、分子標記輔助選擇育種
五、其他應用
參考文獻
第四章 分子標記的應用
第一節(jié) 遺傳標記在植物遺傳學研究中的應用
一、遺傳相似分析
二、遺傳標記間相關性
三、群體的遺傳結構分析
四、數量性狀的遺傳定位
五、全基因組的關聯分析
第二節(jié) DNA指紋圖譜構建
一、DNA指紋圖譜的建立及發(fā)展
二、DNA指紋圖譜實驗原理
三、DNA指紋技術所用的探針
第三節(jié) 常用軟件
一、AMOVA軟件
二、PHYLIP軟件
三、MEGA軟件
四、TREECON軟件
五、RAPD distance
六、DIPLOMO軟件
七、MAPMAKER
八、SPSS軟件
九、對植物EST數據大規(guī)模分析的軟件
參考文獻
第五章 分子標記在椰子資源遺傳評價中的應用
第一節(jié) SSR標記對椰子遺傳多樣性的研究及親緣關系分析
一、研究背景及意義
二、椰子SSR的開發(fā)與驗證
三、SSR與椰子遺傳多樣性研究進展
四、椰子種間多樣性與親緣關系分析
第二節(jié) SSR標記對椰子演化的研究
一、研究背景及意義
二、椰子分類地位的研究
三、SSR標記對椰子演化的研究
參考文獻
第六章 椰子DNA分子標記的研究現狀及應用前景
第一節(jié) 椰子主要性狀相關標記的研究現狀
一、抗病性遺傳育種
二、種質高度與育種
第二節(jié) 椰子DNA分子標記及分子輔助僦術的應用前景
一、遺傳圖譜的構建
二、性狀關聯與QTL定位
三、椰子基因組測序及全基因組關聯分析
四、分子輔助育種技術的應用前景
參考文獻