目前，執(zhí)行地表水（環(huán)境）功能區(qū)劃和國(guó)家地表水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)是我國(guó)區(qū)域性水環(huán)境管理的主要手段，以此為核心圍繞水質(zhì)目標(biāo)、水環(huán)境功能區(qū)達(dá)標(biāo)制定水環(huán)境管理的策略和方法，在解決我國(guó)水資源管理、水污染控制等方面發(fā)揮了重要作用，卻難以滿(mǎn)足恢復(fù)和保護(hù)流域生態(tài)系統(tǒng)健康的需求，特別是對(duì)物種和種群的保護(hù)、棲息地的恢復(fù)、濕地的保護(hù)、生態(tài)容量、水陸統(tǒng)籌管理等，缺乏行之有效的管理手段。
　　2015年9月，中共中央、國(guó)務(wù)院印發(fā)《生態(tài)文明體制改革總體方案》，明確提出要樹(shù)立山水林田湖是一個(gè)生命共同體的理念，按照生態(tài)系統(tǒng)的整體性、系統(tǒng)性及其內(nèi)在規(guī)律，統(tǒng)籌考慮自然生態(tài)各要素，進(jìn)行整體保護(hù)、系統(tǒng)修復(fù)、綜合治理，增強(qiáng)生態(tài)系統(tǒng)循環(huán)能力，維護(hù)生態(tài)平衡。2015年4月，國(guó)務(wù)院出臺(tái)《水污染防治行動(dòng)計(jì)劃》，其中第二十五條深化重點(diǎn)流域污染防治明確提出研究建立流域水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)管理體系。
　　水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)，是依據(jù)河流生態(tài)學(xué)中的格局與尺度理論，反映流域水生態(tài)系統(tǒng)在不同空間尺度下的分布格局，基于流域水生態(tài)系統(tǒng)空間特征差異，結(jié)合人類(lèi)活動(dòng)影響因素而提出的一種分區(qū)方法。它是水環(huán)境管理從水質(zhì)目標(biāo)管理向水生態(tài)健康管理拓展的基礎(chǔ)管理單元，是確定流域水生態(tài)保護(hù)與水質(zhì)管理目標(biāo)的基礎(chǔ)。國(guó)家水體污染控制與治理科技重大專(zhuān)項(xiàng)在十一五期間開(kāi)展了水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)研究，完成了全國(guó)十大流域水生態(tài)一級(jí)、二級(jí)分區(qū)的劃分，并重點(diǎn)劃分了太湖、遼河兩大流域三級(jí)分區(qū)；十二五期間在太湖流域又進(jìn)一步開(kāi)展了三級(jí)水生態(tài)功能分區(qū)的示范與應(yīng)用研究。
　　為了推進(jìn)江蘇省生態(tài)文明建設(shè)，改善流域水環(huán)境質(zhì)量，加強(qiáng)流域水生態(tài)環(huán)境保護(hù)，保障流域水生態(tài)系統(tǒng)健康，在之前研究成果基礎(chǔ)上，進(jìn)一步結(jié)合江蘇省實(shí)際情況，通過(guò)對(duì)太湖流域水文一水質(zhì)一水生態(tài)的系統(tǒng)調(diào)查、水生態(tài)健康指數(shù)指標(biāo)體系的建立、流域重要保護(hù)物種的研究，在太湖流域（江蘇）劃分了49個(gè)水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)，對(duì)各生態(tài)分區(qū)的生態(tài)功能與服務(wù)功能的判別，制定了三類(lèi)四級(jí)水生態(tài)管控目標(biāo)，初步構(gòu)建了太湖流域（江蘇）分區(qū)、分級(jí)、分類(lèi)、分期水生態(tài)健康管理體系，進(jìn)而推進(jìn)江蘇省環(huán)境管理實(shí)現(xiàn)四個(gè)轉(zhuǎn)變：從保護(hù)水資源的利用功能向保護(hù)水生態(tài)服務(wù)功能轉(zhuǎn)變，從單一水質(zhì)目標(biāo)管理向水質(zhì)、水生態(tài)雙重管理轉(zhuǎn)變，從目標(biāo)總量控制向容量總量控制轉(zhuǎn)變，從水陸并行管理向水陸統(tǒng)籌管理轉(zhuǎn)變，促進(jìn)流域水生態(tài)系統(tǒng)健康與社會(huì)經(jīng)濟(jì)協(xié)調(diào)可持續(xù)發(fā)展。
　　該項(xiàng)工作始于水專(zhuān)項(xiàng)研究，但也受到了江蘇省環(huán)保廳領(lǐng)導(dǎo)的高度重視，研究成果多次征詢(xún)了環(huán)保部原污防司、江蘇省各相關(guān)部門(mén)、太湖流域各地市政府、太湖流域各地市環(huán)保系統(tǒng)以及江蘇省太湖流域水污染防治辦公室相關(guān)領(lǐng)導(dǎo)和專(zhuān)家的意見(jiàn)和建議，目前己融入江蘇省環(huán)保廳的行政管理工作之中。成果為地方政府建立了一套基于水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)的流域水生態(tài)健康管理體系，實(shí)現(xiàn)了與現(xiàn)有水環(huán)境管理日常工作的并軌運(yùn)行。研究形成的水生態(tài)管理、空間管控和物種保護(hù)三大類(lèi)目標(biāo)將分為分近、遠(yuǎn)期實(shí)施，指導(dǎo)地方政府對(duì)水生態(tài)環(huán)境功能分區(qū)進(jìn)行考核與管理，進(jìn)而為江蘇省太湖流域的水環(huán)境、水生態(tài)管理、各區(qū)域制定社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展規(guī)劃、環(huán)境管理制度等工作提供基礎(chǔ)依據(jù)，為江蘇省太湖流域水環(huán)境管理決策提供基礎(chǔ)支撐，促進(jìn)環(huán)境與經(jīng)濟(jì)發(fā)展相協(xié)調(diào)，保障生態(tài)系統(tǒng)健康與經(jīng)濟(jì)可持續(xù)發(fā)展，最終實(shí)現(xiàn)推動(dòng)流域污染物總量減排，水質(zhì)改善、水生態(tài)健康的目標(biāo)。
　　本書(shū)是國(guó)家水體污染控制與治理科技重大專(zhuān)項(xiàng)太湖流域（江蘇）水生態(tài)功能分區(qū)與標(biāo)準(zhǔn)管理工程建設(shè)課題太湖流域（江蘇）水生態(tài)功能分區(qū)管理示范子課題（編號(hào)：2012ZX07506-001-001）研究成果的總結(jié)。感謝江蘇省環(huán)境保護(hù)廳、中國(guó)科學(xué)院南京地理與湖泊研究所、中國(guó)環(huán)境科學(xué)研究院、江蘇省環(huán)境監(jiān)測(cè)中心等單位領(lǐng)導(dǎo)與同行的幫助，在此一并表示感謝。
　　由于編者學(xué)術(shù)水平有限，書(shū)中難免存在差錯(cuò)、遺漏等諸多不足之處，敬請(qǐng)學(xué)術(shù)界同行與廣大讀者批評(píng)指正。