《代號(hào)D機(jī)關(guān)Ⅲ》講述了在“魔王”結(jié)城中校的主持下，日本陸軍內(nèi)部成產(chǎn)了間諜培訓(xùn)學(xué)�！癉機(jī)關(guān)”。在這里，所有成員都被灌輸了與武士精神相悖的最高原則：不許殺人，不許自殺！這樣的組織自然成為各方勢(shì)力的眼中釘，然而結(jié)城以他魔術(shù)師般的高超手段，交出了令人瞠目結(jié)舌的諜戰(zhàn)成績(jī)單。
　　此時(shí)，一個(gè)試圖挖掘結(jié)城真實(shí)身份的男人出現(xiàn)了。他是英國(guó)泰晤士報(bào)的遠(yuǎn)東特派員阿隆·普萊斯。可是，結(jié)城宛如幽靈一樣，沒(méi)有留下任何足跡。某一天，普萊斯由一個(gè)意外的發(fā)現(xiàn)開(kāi)始，逐漸了解了結(jié)城令人意外的成長(zhǎng)史……
　　巴黎、東京、新加坡、夏威夷，貫穿四地、緊張刺激的諜戰(zhàn)大戲再次展開(kāi)。