分子生物學(xué)（第二版）——楊榮武教授十年心血之作，生化及分子生物學(xué)學(xué)習(xí)寶典

楊榮武  主編  定價：118.00元

ISBN  978-7-305-18569-7

南京大學(xué)出版社2017年9月版

作者簡介

楊榮武  博士，現(xiàn)任南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授。先后作為訪問學(xué)者赴香港科技大學(xué)和美國加州大學(xué)圣地亞哥分校從事科學(xué)研究和教學(xué)實(shí)踐。

楊榮武教授長期從事生物化學(xué)的教學(xué)和研究工作，一直以“啟發(fā)誘導(dǎo)式的雙語教學(xué)、善于將復(fù)雜深奧的內(nèi)容簡單化和形象化以及與多媒體的緊密結(jié)合”為自己的教學(xué)特色，深受學(xué)生們的喜愛和同行的高度認(rèn)可，并在全國生化教學(xué)界有一定的影響，目前是中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會教學(xué)專業(yè)委員會常委委員。2016年，先后榮獲亞洲及大洋州生物化學(xué)家與分子生物學(xué)家聯(lián)盟教育獎（FAOBMB Education Award 2016）和寶鋼教育基金優(yōu)秀教師特等獎提名獎。2015—2017年，連續(xù)獲得南京大學(xué)第十一屆、第十二屆和第十三屆“我最喜愛的老師”的榮譽(yù)稱號。

主講的“生物化學(xué)”獲國家精品課程，主持的“生物化學(xué)”不僅為江蘇省和國家雙語示范課程，還是國家精品資源共享課程，目前在愛課程網(wǎng)上深受全國修課者的喜愛，講授的“結(jié)構(gòu)生物化學(xué)”MOOC已在Coursera和中國大學(xué)MOOC課程網(wǎng)上上線，受到全球修讀者的歡迎。主編的《生物化學(xué)原理》為國家“十二五”、“十一五”規(guī)劃教材以及國家精品教材，主編的《分子生物學(xué)》第一版獲得華東地區(qū)大學(xué)出版社優(yōu)秀教材評比一等獎。此外，還主編過其他教材和輔助教材10多部。

內(nèi)容簡介

1926年摩爾根“基因論”的發(fā)表，確立了基因是遺傳的基本單位，它存在于細(xì)胞的染色體上，決定著生物體的性狀。但關(guān)于基因的化學(xué)本質(zhì)是什么，它通過什么方式影響生物體的遺傳性狀，仍然不清楚。揭示基因的本質(zhì)及其作用方式就成了當(dāng)時生物學(xué)研究的核心問題。對這個問題的研究，開創(chuàng)了分子生物學(xué)這門新學(xué)科。分子生物學(xué)的建立和發(fā)展是生物學(xué)中信息學(xué)派、結(jié)構(gòu)學(xué)派和生化遺傳學(xué)派研究成果結(jié)合的產(chǎn)物，是科學(xué)史上一次成功的由學(xué)科交叉融合而引起的科學(xué)革命。發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋的故事已為人們廣為傳頌，并作為生物學(xué)史上最具傳奇色彩的偉大發(fā)現(xiàn)而載入生命科學(xué)史冊。同樣，與日新月異的分子生物學(xué)發(fā)展相比，就急需一本既與時俱進(jìn)又通俗易懂的新教材。

本書共分為十三章，系統(tǒng)闡述了分子生物學(xué)基本原理、知識和技術(shù)，并反映了這一領(lǐng)域的最新進(jìn)展。內(nèi)容包括遺傳物質(zhì)的分子本質(zhì)；基因、基因組和基因組學(xué)；DNA的生物合成、損傷、修復(fù)和突變；DNA重組；RNA的生物合成；轉(zhuǎn)錄后加工；蛋白質(zhì)的生物合成，翻譯后加工、分揀、定向和水解；原核、真核生物的基因表達(dá)調(diào)控；現(xiàn)代分子生物學(xué)方法等。

本書可供高等院校生物科學(xué)、生物技術(shù)、臨床醫(yī)學(xué)等相關(guān)專業(yè)的教師和學(xué)生使用，也可作為相關(guān)專業(yè)研究人員的參考書。

主營銷語：

1. 楊榮武教授十年心血之作，生化及分子生物學(xué)學(xué)習(xí)寶典。

2. 本書榮獲“華東六省一市大學(xué)出版社優(yōu)秀教材一等獎”。

3.本書作者 2016年，先后榮獲亞洲及大洋州生物化學(xué)家與分子生物學(xué)家聯(lián)盟教育獎（FAOBMB Education Award 2016）和寶鋼教育基金優(yōu)秀教師特等獎提名獎。2015—2017年，連續(xù)獲得南京大學(xué)第十一屆、第十二屆和第十三屆“我最喜愛的老師”的榮譽(yù)稱號。

4.楊榮武教授主講的“生物化學(xué)”獲國家精品課程，主持的“生物化學(xué)”不僅為江蘇省和國家雙語示范課程，還是國家精品資源共享課程，目前在愛課程網(wǎng)上深受全國修課者的喜愛，講授的“結(jié)構(gòu)生物化學(xué)”MOOC已在Coursera和中國大學(xué)MOOC課程網(wǎng)上上線，受到全球修讀者的歡迎。

賣點(diǎn)分析:

1.本書再版內(nèi)容進(jìn)行了全面的更新，包括每一章后面提供的文獻(xiàn)和推薦網(wǎng)址。例如，增加了CRISPR系統(tǒng)、基因組編輯、表觀遺傳、lnRNA和新一代DNA測序技術(shù)等內(nèi)容，引用文獻(xiàn)截止到2017年8月。

2.可讀性、易讀性進(jìn)一步提高。全書的每一個句子都經(jīng)過了字斟句酌、反復(fù)推敲。

3.全書結(jié)構(gòu)體系作了一些調(diào)整，特別是考慮到古菌與真核生物在分子生物學(xué)的各種機(jī)制上更加相似，因此不再簡單地按照原核生物和真核生物來組織各章內(nèi)容，而是按照細(xì)菌、真核生物和古菌三個域來組織。

4.教材中引入了新的元素，就是文中穿插了許多小框和隨文小測驗(yàn)（quiz），小框中有分子生物學(xué)的最新動態(tài)、趣事、應(yīng)用和科學(xué)小故事等。小框中豐富多彩的內(nèi)容可進(jìn)一步激發(fā)讀者學(xué)習(xí)分子生物學(xué)的興趣，而小測驗(yàn)可以讓讀者帶著問題去學(xué)習(xí)。另外，每一章的小結(jié)仍然設(shè)計成填充的形式，這樣可以讓讀者自己去總結(jié)。

5.特配數(shù)字課程，內(nèi)有楊榮武教授講授的本課程的全程錄像，讀者可以利用書中的二維碼，在有網(wǎng)絡(luò)的情況下隨時觀看錄像視頻，此外，還有許多輔助教學(xué)和學(xué)習(xí)的資料可供下載。這不僅有助于讀者的學(xué)習(xí)和教師的教學(xué)，還在讀者和編者之間提供了一種相互交流和學(xué)習(xí)的平臺。

6.提供了四套PPT課件，中、英文簡版和全版各一套，相信這對于許多學(xué)校正在推行的雙語教學(xué)應(yīng)該很有幫助。

7.為了提高學(xué)習(xí)效果，本版改為了雙色版，從而使反應(yīng)主線特別是圖表顯示的部分更加突出、內(nèi)容更加鮮活生動。

8.配套的《分子生物學(xué)學(xué)習(xí)指南與習(xí)題解析》將很快更新。

推薦語

本書榮獲“華東六省一市大學(xué)出版社優(yōu)秀教材一等獎”，再版在保留第一版全部優(yōu)點(diǎn)和特色的基礎(chǔ)上，做了許多優(yōu)化、改進(jìn)和創(chuàng)新。是一本知識內(nèi)容豐富，配套資源齊全，具有互聯(lián)網(wǎng)立體化交互功能，制作優(yōu)良，很注重學(xué)習(xí)體驗(yàn)與效果的好書。

目錄

第一章緒論

第一節(jié)分子生物學(xué)的起源

一、傳遞遺傳學(xué)

二、分子遺傳學(xué) 

第二節(jié)分子生物學(xué)的發(fā)展

一、DNA的半保留復(fù)制

二、基因與蛋白質(zhì)之間的關(guān)系

三、“中心法則”

四、基因工程

Box 1-1讓“酵母君”釀造鴉片，你相信嗎？

五、分子生物學(xué)的其他進(jìn)展

第三節(jié) 分子生物學(xué)學(xué)習(xí)方法

科學(xué)故事——朊病毒的發(fā)現(xiàn)

第二章 遺傳物質(zhì)的分子本質(zhì)

第一節(jié) 遺傳物質(zhì)的分子本質(zhì)

一、DNA是主要的遺傳物質(zhì)

（一） 細(xì)菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)

（二） HersheyChase的噬菌體實(shí)驗(yàn)

二、RNA也可以作為遺傳物質(zhì)

三、某些蛋白質(zhì)具有遺傳物質(zhì)的特性

第二節(jié) 核酸的結(jié)構(gòu)

一、核酸的化學(xué)組成

Box 2-1環(huán)狀非編碼RNA

二、核酸的一級結(jié)構(gòu)

（一） 第一代DNA測序

（二） 第二代DNA測序

（三） 第三代DNA測序

（四） 第四代DNA測序

（五） 單細(xì)胞基因組DNA測序

三、核酸的二級結(jié)構(gòu)

（一） DNA的二級結(jié)構(gòu)

（二） RNA的二級結(jié)構(gòu)

Box 2-2為何是DNA而不是RNA作為遺傳信息的載體？

四、核酸的三級結(jié)構(gòu)

（一） DNA的三級結(jié)構(gòu)

（二） RNA的三級結(jié)構(gòu)

五、核酸與蛋白質(zhì)形成的復(fù)合物

（一） DNA與蛋白質(zhì)形成的復(fù)合物

（二） RNA與蛋白質(zhì)形成的復(fù)合物

第三節(jié) 核酸的理化性質(zhì)

科學(xué)故事——究竟是誰第一個發(fā)現(xiàn)了DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)？

第三章 基因、基因組和基因組學(xué)

第一節(jié) 基因

一、對基因的認(rèn)識

二、基因概念的擴(kuò)展

（一） 移動基因

（二） 斷裂基因

（三） 假基因

Box 3-1假基因，真表達(dá)，真功能

（四） 重疊基因

三、基因的種類和結(jié)構(gòu)

（一） 基因的種類

（二） 基因的結(jié)構(gòu)

四、基因的大小和數(shù)目

（一） 基因的大小

（二） 基因的數(shù)目

Box 3-2我們究竟有多少個基因？

（三） N值矛盾

五、基因簇與重復(fù)基因

（一） 基因家族和基因簇

（二） 重復(fù)序列

第二節(jié)基因組

一、病毒基因組

（一） DNA病毒基因組

Box 3-3大病毒、大驚喜

（二） RNA病毒基因組

（三） 類病毒和擬病毒基因組

二、原核生物基因組

（一） 細(xì)菌基因組

（二） 古菌基因組

（三） 質(zhì)粒

三、真核生物基因組

（一） 核基因組

（二） 細(xì)胞器基因組

Box 3-4線粒體夏娃

四、人類基因組

第三節(jié)基因組學(xué)

一、結(jié)構(gòu)基因組學(xué)

（一） 基因組作圖

（二） 基因組測序

（三） 基因組計劃

二、功能基因組學(xué)

（一） 轉(zhuǎn)錄組與轉(zhuǎn)錄組學(xué)

（二） 蛋白質(zhì)組與蛋白質(zhì)組學(xué)

（三） 表觀基因組學(xué)

（四） 宏基因組學(xué)

（五） 比較基因組學(xué)

Box 3-5甲基化讓人類和猴子分了家？

三、生物信息學(xué)

（一） 生物信息學(xué)資源

（二） 生物信息學(xué)的目標(biāo)和任務(wù)

科學(xué)故事——維生素C與假基因

第四章DNA的生物合成

第一節(jié)DNA復(fù)制

一、DNA復(fù)制的基本特征

Box 4-1“生命字母表”的人工擴(kuò)增

Box 4-2岡崎令治與岡崎片段

二、DNA復(fù)制的酶學(xué)

（一） DNAP

（二） DNA解鏈酶

（三） SSB

（四） DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶

（五） DNA引發(fā)酶

（六） 切除引物的酶

（七） DNA連接酶

（八） 尿嘧啶DNA糖苷酶

（九） 端粒酶

三、DNA復(fù)制的詳細(xì)機(jī)制

（一） 以大腸桿菌為代表的細(xì)菌基因組DNA的復(fù)制

（二） 滾環(huán)復(fù)制

（三） D環(huán)復(fù)制

（四） 真核細(xì)胞細(xì)胞核DNA的復(fù)制

Box 4-3線形DNA末端復(fù)制的難題的解決

（五） 古菌的DNA復(fù)制

四、DNA復(fù)制的高度忠實(shí)性

五、DNA復(fù)制的調(diào)控

（一） 細(xì)菌DNA復(fù)制起始的調(diào)控

（二） 大腸桿菌質(zhì)粒ColE1的復(fù)制調(diào)控

（三） 真核細(xì)胞核DNA復(fù)制起始的調(diào)控

第二節(jié)逆轉(zhuǎn)錄

一、逆轉(zhuǎn)錄病毒的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)

（一） 逆轉(zhuǎn)錄病毒的結(jié)構(gòu)

（二） 逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活史

Box 4-4HIV輔助受體的發(fā)現(xiàn)

（三） 艾滋病的治療

二、其他的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)

（一） 逆轉(zhuǎn)座子

（二） 逆轉(zhuǎn)錄質(zhì)粒（retroplasmid）與逆轉(zhuǎn)錄內(nèi)含子(retrointron)

（三） 逆轉(zhuǎn)子

（四） 某些DNA病毒生活史中的逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象

科學(xué)故事——DNA半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)證明

第五章DNA的損傷、修復(fù)和突變

第一節(jié)DNA損傷

一、導(dǎo)致DNA損傷的因素

二、DNA損傷的類型

第二節(jié)細(xì)胞對DNA損傷做出的反應(yīng)

Box 5-1為什么某些哺乳動物不得或少得癌癥？

第三節(jié)DNA的修復(fù)

一、直接修復(fù)

二、切除修復(fù)

Box 5-2額外的DNA序列充當(dāng)我們基因組的“備胎”

（一） BER

（二） NER

（三） MMR

Box 5-3真核生物錯配修復(fù)系統(tǒng)如何發(fā)現(xiàn)錯配堿基？

三、DSBR

四、損傷跨越(damage bypass)

（一） 重組跨越

（二） 跨損傷合成

五、一些與DNA修復(fù)缺陷有關(guān)的遺傳性疾病以及修復(fù)缺陷與癌癥之間的關(guān)系

第四節(jié)DNA的突變

一、突變的類型與后果

（一） 點(diǎn)突變

（二） 移碼突變

（三） 隱性突變和顯性突變

二、突變的原因

（一） 自發(fā)突變

Box 5-4三聚核苷酸重復(fù)與脆性X染色體綜合征

（二） 誘發(fā)突變

三、正向突變、回復(fù)突變與突變的校正

（一） 正向突變和回復(fù)突變

（二） 校正突變

四、突變原與致癌物之間的關(guān)系以及致癌物的檢測

科學(xué)故事——p53從癌蛋白到抗癌蛋白的角色轉(zhuǎn)換

第六章DNA重組

第一節(jié)同源重組

一、同源重組的分子機(jī)制

（一） Holliday模型

（二） 單鏈斷裂模型

（三） 雙鏈斷裂模型

二、細(xì)菌的同源重組

（一） 參與同源重組的主要蛋白質(zhì)

（二） 大腸桿菌幾種重要的同源重組途徑

三、真核生物的同源重組

四、古菌的同源重組

第二節(jié)位點(diǎn)特異性重組

一、λ噬菌體的位點(diǎn)特異性整合

二、鼠傷寒沙門氏菌鞭毛抗原的轉(zhuǎn)換

Box 6-1Cre LoxP重組系統(tǒng)及其改造和應(yīng)用

第三節(jié)轉(zhuǎn)座重組

一、細(xì)菌的轉(zhuǎn)座子

（一） 第一類轉(zhuǎn)座子

（二） 第二類轉(zhuǎn)座子

（三） 第三類轉(zhuǎn)座子

（四） 第四類轉(zhuǎn)座子

二、真核生物的轉(zhuǎn)座子

（一） DNA轉(zhuǎn)座子

Box 6-2睡美人轉(zhuǎn)座子的復(fù)活

（二） 逆轉(zhuǎn)座子 

三、古菌的轉(zhuǎn)座子

四、轉(zhuǎn)座的分子機(jī)制

（一） 簡單轉(zhuǎn)座

（二） 復(fù)制型轉(zhuǎn)座

Box 6-3誰偷走了人的DNA？

五、轉(zhuǎn)座作用的調(diào)節(jié)

科學(xué)故事——“跳躍基因”的發(fā)現(xiàn)

第七章RNA的生物合成

第一節(jié)DNA轉(zhuǎn)錄

一、轉(zhuǎn)錄的一般特征

二、催化DNA轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶

（一） 細(xì)菌的RNAP

（二） 古菌的RNAP

（三） 真核細(xì)胞的RNAP

（四） 由病毒編碼的RNAP

Box 7-1植物細(xì)胞RNAPⅣ的發(fā)現(xiàn)故事

三、RNAP的三維結(jié)構(gòu)與功能

四、細(xì)菌的DNA轉(zhuǎn)錄

（一） 轉(zhuǎn)錄的起始

五、真核生物的核基因轉(zhuǎn)錄

（一） 真核生物細(xì)胞核基因轉(zhuǎn)錄與細(xì)菌基因轉(zhuǎn)錄的主要差別268

（二） 真核細(xì)胞核DNA轉(zhuǎn)錄的基本過程

Box 7-2細(xì)胞的記憶機(jī)制

六、真核生物細(xì)胞器DNA的轉(zhuǎn)錄

（一） 線粒體DNA的轉(zhuǎn)錄

（二） 葉綠體DNA的轉(zhuǎn)錄

七、古菌的DNA轉(zhuǎn)錄

第二節(jié)RNA復(fù)制

Box 7-3RNA重組

一、雙鏈RNA病毒的RNA復(fù)制

二、單鏈RNA病毒的RNA復(fù)制

（一） 正鏈RNA病毒的RNA復(fù)制

Box 7-4蝙蝠抵抗病毒和長壽的秘密

（二） 負(fù)鏈RNA病毒的RNA復(fù)制

科學(xué)故事——人類和酵母居然如此相似！

第八章轉(zhuǎn)錄后加工

第一節(jié)細(xì)菌RNA前體的后加工

一、mRNA前體的后加工

二、rRNA前體的后加工

（一） 剪切和修剪

（二） 核苷酸的修飾

三、tRNA前體的后加工

（一） 剪切和修剪

（二） 核苷酸的修飾

（三） 添加CCA

（四） 剪接

第二節(jié)真核細(xì)胞RNA前體的后加工

一、mRNA前體的后加工

（一） 5′端“加帽”

（二） 3′端“加尾”

Box 8-1CTD密碼

（三） 無尾巴的mRNA在3-端的后加工

（四） 內(nèi)部甲基化

（五） 剪接

Box 8-2剪接體是核酶嗎？

Box 8-3次要剪輯途徑也重要

（六） 編輯

二、rRNA前體的后加工

（一） 剪切、修剪和修飾

（二） 四膜蟲26S rRNA前體的自剪接

Box 8-4“RNA世界”的探索之旅

三、tRNA前體的后加工

第三節(jié)古菌的轉(zhuǎn)錄后加工

科學(xué)故事——第一例真正的核酶的發(fā)現(xiàn)

第九章蛋白質(zhì)的生物合成

第一節(jié)參與翻譯的各種生物大分子的結(jié)構(gòu)與功能

一、核糖體

（一） 小亞基

（二） 大亞基

（三） 核糖體的三維結(jié)構(gòu)及其功能定位

（四） 核糖體組裝和循環(huán)

二、mRNA

三、tRNA

（一） tRNA的一級結(jié)構(gòu)

（二） tRNA的二級結(jié)構(gòu)

（三） tRNA的三級結(jié)構(gòu)

四、氨酰tRNA合成酶

Box 9-1tRNA的新功能——衍生于tRNA的促癌小RNA的發(fā)現(xiàn)

五、輔助蛋白因子

第二節(jié)翻譯的一般性質(zhì)

一、均可分為氨基酸的活化、起始、延伸和終止四個階段

二、翻譯具有極性

三、三聯(lián)體密碼

（一） 遺傳密碼的破譯

（二） 遺傳密碼的主要性質(zhì)

四、反密碼子決定特異性

五、擺動規(guī)則

第三節(jié)翻譯的詳細(xì)機(jī)制

一、細(xì)菌的翻譯

（一） 氨基酸的活化

（二） 翻譯的起始

（三） 翻譯的延伸

（四） 翻譯的終止和核糖體的循環(huán)

Box 9-2改造大腸桿菌的編碼系統(tǒng)

二、真核生物的細(xì)胞質(zhì)翻譯系統(tǒng)

（一） 氨基酸的活化

（二） 翻譯的起始

（三） 肽鏈的延伸

（四） 翻譯的終止和核糖體的循環(huán)

三、細(xì)胞器翻譯系統(tǒng)

四、古菌的翻譯系統(tǒng)

第四節(jié)翻譯的質(zhì)量控制

一、細(xì)菌的翻譯質(zhì)量控制

（一） 由tmRNA介導(dǎo)的翻譯質(zhì)量控制

（二） 不依賴tmRNA的翻譯質(zhì)量控制

二、真核生物的翻譯質(zhì)量控制

三、古菌翻譯系統(tǒng)的質(zhì)量控制

第五節(jié)再次程序化的遺傳解碼

一、翻譯水平的移框

二、通讀

三、跳躍翻譯

四、硒代半胱氨酸和吡咯賴氨酸的參入

第六節(jié)翻譯的抑制劑

一、細(xì)菌翻譯系統(tǒng)的抑制劑

二、真核生物翻譯系統(tǒng)的抑制劑

三、既抑制細(xì)菌又抑制真核生物翻譯系統(tǒng)的抑制劑

科學(xué)故事——RNA領(lǐng)帶俱樂部與遺傳密碼的破譯

第十章蛋白質(zhì)的翻譯后加工、分揀、定向和水解

第一節(jié)翻譯后加工

一、多肽鏈的剪切和修剪

二、N端添加氨基酸

三、蛋白質(zhì)剪接

四、個別氨基酸殘基的修飾

五、形成二硫鍵

六、添加輔助因子

七、多肽鏈的折疊

Box 10-1霍亂毒素的胞內(nèi)之亂

八、四級結(jié)構(gòu)的形成

第二節(jié)蛋白質(zhì)翻譯后的定向與分揀

Box 10-2“分子郵政編碼”的發(fā)現(xiàn)

一、共翻譯途徑

二、翻譯后途徑

（一） 線粒體蛋白的定向與分揀

（二） 葉綠體蛋白的定向和分揀

（三） 某些線粒體蛋白和葉綠體蛋白的雙重定向與分揀

（四） 核蛋白的定向與分揀

（五） 過氧化物酶體蛋白的定向與分揀

（六） 細(xì)菌蛋白的定向與分揀

（七） 古菌蛋白質(zhì)的定向和分揀 

第三節(jié)細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的選擇性降解

一、真核生物細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)降解系統(tǒng)

（一） 泛素的結(jié)構(gòu)與功

（二） 泛�；磻�(yīng)及其功能

（三） 泛酰化反應(yīng)的信號

（四） 蛋白酶體的結(jié)構(gòu)與功能

二、細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)降解系統(tǒng)

三、古菌細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)降解系統(tǒng)

科學(xué)故事——7SL RNA的發(fā)現(xiàn) 

第十一章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控

第一節(jié)正調(diào)控與負(fù)調(diào)控

第二節(jié)在DNA水平上的調(diào)控

一、基因的拷貝數(shù)

二、啟動子的強(qiáng)弱

三、DNA重排 

第三節(jié)在轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控

一、轉(zhuǎn)錄起始階段的調(diào)控

（一） 細(xì)菌對不同σ因子的選擇性使用

（二） 操縱子調(diào)控模型

Box 11-1古菌的色氨酸操縱子

二、轉(zhuǎn)錄終止水平上的調(diào)控——終止與抗終止

（一） 弱化

（二） 核開關(guān)

（三） 抗終止作用 

第四節(jié)在翻譯水平上的調(diào)控

一、反義RNA

（一） 反義RNA的負(fù)調(diào)控作用

（二） 反義RNA的正調(diào)控作用

二、核開關(guān)

三、自體調(diào)控

四、mRNA的降解

五、mRNA的二級結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)的調(diào)控

Box 11-2RNA溫度計 

第五節(jié)環(huán)境信號誘發(fā)的基因表達(dá)調(diào)控

一、嚴(yán)緊反應(yīng)

Box 11-3TA系統(tǒng)的威力

二、CRISPRCas系統(tǒng)

（一） CRISPR序列

（二） Cas蛋白

三、二元基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)

四、群體感應(yīng) 

第六節(jié)在基因組水平上的全局調(diào)控

一、調(diào)節(jié)子

二、噬菌體基因表達(dá)的時序控制

科學(xué)故事——乳糖操縱子發(fā)現(xiàn)歷程 

第十二章真核生物的基因表達(dá)調(diào)控

第一節(jié)在染色質(zhì)水平上的基因表達(dá)調(diào)控

一、組蛋白的化學(xué)修飾對基因表達(dá)的影響

二、染色質(zhì)重塑因子對基因表達(dá)的影響

三、組蛋白變體對基因表達(dá)的影響

四、lncRNA對基因表達(dá)的影響 

第二節(jié)在DNA水平上的基因表達(dá)調(diào)控

一、DNA擴(kuò)增

二、DNA重排

（一） 高等動物抗體基因的程序性重排

（二） 錐體蟲主要表面抗原基因的重排

（三） 釀酒酵母在交配類型轉(zhuǎn)換過程中發(fā)生的基因重排

三、基因丟失

四、DNA甲基化

Box 12-1DNA的第六個堿基

五、DNA印記

Box 12-2父親吃啥可通過DNA甲基化影響到你！

六、多個啟動子的選擇性使用 

第三節(jié)在轉(zhuǎn)錄水平上的基因表達(dá)調(diào)控

一、順式作用元件

（一） 增強(qiáng)子

Box 12-3增強(qiáng)子RNA

（二） 沉默子

（三） 絕緣子

（四） 反應(yīng)元件

二、轉(zhuǎn)錄因子

（一） 轉(zhuǎn)錄因子的鑒別、分離和活性測定

（二） 轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與分類

三、參與轉(zhuǎn)錄水平調(diào)節(jié)的lncRNA

四、轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控的實(shí)例

（一） 酵母細(xì)胞半乳糖代謝相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控

（二） 熱休克蛋白的基因表達(dá)調(diào)控

（三） 脂溶性激素誘導(dǎo)的基因表達(dá)調(diào)控

（四） 金屬硫蛋白的基因表達(dá)調(diào)控

（五） 生物發(fā)育過程中的組織特異性基因表達(dá)

（六） 轉(zhuǎn)錄終止階段的調(diào)控

Box 12-4能將老鼠變成蛇嗎？

五、轉(zhuǎn)錄后加工水平上的基因表達(dá)調(diào)控

（一） 選擇性剪接

（二） 選擇性加尾

（三） 組織特異性RNA編輯

（四） lncRNA在轉(zhuǎn)錄后加工水平的調(diào)控

六、在mRNA 運(yùn)輸水平上的調(diào)控

七、翻譯水平上的調(diào)控

Box 12-5正義和反義RNA之間的較量

（一） 自體調(diào)控

（二） mRNA區(qū)域化

（三） mRNA的“屏蔽”

（四） RNA干擾

（五） mRNA 的降解和穩(wěn)定性與基因表達(dá)調(diào)控

Box 12-6類病毒的致病機(jī)制

（六） 對翻譯過程本身的調(diào)節(jié)

（七） lncRNA在翻譯水平的調(diào)節(jié)

八、翻譯后水平的調(diào)節(jié)

科學(xué)故事——RNAi的發(fā)現(xiàn) 

第十三章分子生物學(xué)方法

第一節(jié)重組DNA技術(shù)簡介

一、基因克隆的載體

（一） 質(zhì)粒載體

（二） 噬菌體載體

（三） 黏粒

（四） PAC和BAC

（五） YAC和HAC

（六） 真核細(xì)胞病毒載體

二、將外源基因或序列導(dǎo)入載體的工具

（一） RE

（二） DNA連接酶

（三） DNA聚合酶

（四） 逆轉(zhuǎn)錄酶

（五） 核糖核酸酶H

（六） 多聚核苷酸激酶

（七） S1核酸酶

三、宿主細(xì)胞

四、將重組DNA引入到宿主細(xì)胞的途徑

（一） 轉(zhuǎn)化

（二） 轉(zhuǎn)染

（三） 電穿孔

（四） 脂質(zhì)體介導(dǎo)

（五） 彈道基因轉(zhuǎn)移

五、重組體的選擇和篩選

（一） 直接篩選

（二） 間接篩選 

第二節(jié)重組DNA技術(shù)的詳細(xì)步驟

一、外源DNA序列和目的基因的獲得

二、目的基因與載體的連接

（一） 黏端連接

（二） 平端連接

（三） 含有平端和黏端的目的基因與載體之間的連接

三、重組DNA導(dǎo)入特定的宿主細(xì)胞

四、含有目的基因序列的克隆的篩選和鑒定 

第三節(jié)重組DNA技術(shù)的應(yīng)用

一、文庫的建立

（一） 基因組DNA文庫

（二） cDNA文庫

（三） 文庫的篩選

二、DNA序列分析

三、表達(dá)外源蛋白

四、轉(zhuǎn)基因動物、植物及轉(zhuǎn)基因食品

（一） 轉(zhuǎn)基因動物

（二） 轉(zhuǎn)基因植物

（三） 轉(zhuǎn)基因食品

五、基因治療

六、研究基因的功能

七、尋找未知基因

（一） 從基因的終產(chǎn)物開始鑒定新基因

（二） 從核酸水平上尋找新基因 

第四節(jié)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

一、RTPCR

二、反向PCR

三、巢式PCR

四、遞減PCR

五、原位PCR

六、菌落PCR

七、簡并PCR

八、多重PCR

九、不對稱PCR

十、熱不對稱交錯PCR

十一、標(biāo)記PCR

十二、實(shí)時定量PCR 

第五節(jié)蛋白質(zhì)工程

一、隨機(jī)突變

二、定點(diǎn)突變

Box 13-1胰島素的定向改造 

第六節(jié)研究核酸與蛋白質(zhì)之間相互作用的主要方法和技術(shù)

第七節(jié)研究蛋白質(zhì)之間相互作用的主要方法和技術(shù)

一、免疫共沉淀

二、親和層析

三、共價交聯(lián)

四、熒光共振能量轉(zhuǎn)移

五、生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移

六、酵母雙雜交

（一） 酵母雙雜交系統(tǒng)的原理

（二） 酵母雙雜交系統(tǒng)的建立

（三） 酵母雙雜交系統(tǒng)的應(yīng)用

第八節(jié)SELEX技術(shù)

第九節(jié)生物芯片技術(shù)

一、基因芯片

（一） 基因芯片的種類和制備

二、蛋白質(zhì)芯片

（一） 蛋白質(zhì)芯片的基本構(gòu)成

（二） 蛋白質(zhì)芯片的應(yīng)用

第十節(jié)基因組編輯技術(shù)

一、大范圍核酸酶

二、鋅指核酸酶

三、擬轉(zhuǎn)錄激活蛋白效應(yīng)物核酸酶

四、Cas9

Box 13-2CRISPR技術(shù)進(jìn)軍基因治療

科學(xué)故事——綠色熒光蛋白的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展

專業(yè)詞匯英漢對照和索引

常見英文縮寫

主要參考書目