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基于云計(jì)算的生物大數(shù)據(jù)分析研究 讀者對(duì)象:本書可以作為從事生物信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等領(lǐng)域的研究人員,以及對(duì)這些領(lǐng)域的學(xué)生和初學(xué)者培訓(xùn)教材或參考資料,及如何將相關(guān)技術(shù)應(yīng)用到具體的研究中
隨著生物技術(shù)的不斷發(fā)展,高通量測(cè)序技術(shù)得到快速發(fā)展,基因組測(cè)序的成本相對(duì)降低幅度很大,生物數(shù)據(jù)規(guī)模也在隨之增大,生物信息學(xué)也迎來了大數(shù)據(jù)時(shí)代。云計(jì)算技術(shù)可以給生物信息學(xué)在數(shù)據(jù)分析方面提供計(jì)算資源,從而生物信息大數(shù)據(jù)借助大數(shù)據(jù)的生物信息云迎接更多的新挑戰(zhàn),挖掘數(shù)據(jù)中隱藏的資源。通過本項(xiàng)目的研究,也可為以后云計(jì)算在其他生物信息學(xué)問題中運(yùn)用的研究做出基礎(chǔ)工作。介紹基于云平臺(tái)的機(jī)器學(xué)習(xí)發(fā)展歷程,包括HadoopMapReduce、HDFS、Mahout、Spark及Yarn的主要研究現(xiàn)狀和意義,同時(shí)介紹生物信息學(xué)中基因組數(shù)據(jù)分析的現(xiàn)狀及本文主要的工作任務(wù)和結(jié)構(gòu)安排。本研究主要擬通過使用各種相關(guān)云計(jì)算技術(shù),解決在RNA-Seq數(shù)據(jù)分析任務(wù)中存在的各種性能問題,提高研究而利用基于云計(jì)算技術(shù)的生物大數(shù)據(jù)可視化平臺(tái)來直觀的人員的工作效,利用云計(jì)算技術(shù)來構(gòu)建生物大數(shù)據(jù)可視化平臺(tái),從展現(xiàn)出測(cè)序數(shù)據(jù)和分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)據(jù)等多種類的生物數(shù)據(jù),為生物學(xué)和醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域研究提供可視化的基礎(chǔ)軟件設(shè)施。
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