本書主要介紹了國內外水環(huán)境領域前沿的微生物群落結構解析的實驗方法,包括水環(huán)境樣品(淡水和沉積物)DNA提取方法、變形梯度凝膠電泳(DGGE)技術、末端限制性片段長度多態(tài)性(T—RFLP)技術、脈沖場電泳技術(PFGE)、Biolog微生物群落生理學(CLPP)技術、MIDI脂肪酸(FAA)技術等內容。
李冬梅,哈爾濱工業(yè)大學環(huán)境學院高級工程師。主持、參與并完成國家自然基金和國家重大專項5項;獲哈爾濱工業(yè)大學教學成果獎1項;獲國家發(fā)明專利6項;近年來發(fā)表SCI文章10余篇,出版教材1部。研究方向:環(huán)境微生物、生物質能。
第1章 樣品核酸的提取
1.1 淡水微生物DNA的提取
1.2 水中沉積物微生物DNA的提取
1.3 提取DNA的純化
1.4 小結
參考文獻
第2章 變性梯度凝膠電泳(DGGE)
2.1 變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術簡介
2.2 DGGE操作過程
2.3 PCR-DGGE分析真菌群落
參考文獻
第3章 微生物群落的末端限制性片段長度多態(tài)性分析(T-RFLP)
3.1 實驗過程
3.2 微生物種群的比較分析
3.3 操作步驟
3.4 實驗說明
參考文獻
第4章 脈沖場凝膠電泳(PFGE)
4.1 PFGE的原理
4.2 影響PFGE分辨率的因素
4.3 基因分型原理
4.4 PulseNet相關知識
4.5 PFGE基因分型技術的應用
參考文獻
第5章 微生物代謝的Biolog微平板法
5.1 BiologGENIII(GN/GP)微生物鑒定板
5.2 BiologAN微生物鑒定板
5.3 BiologFF微生物鑒定板
5.4 BiologYT微生物鑒定板
5.5 BiologEco微生物鑒定板
參考文獻
第6章 微生物分類學和生態(tài)學中的脂肪酸分析
6.1 純培養(yǎng)微生物的鑒定
6.2 磷脂脂肪酸圖譜法(PLFA)測定微生物群落結構
參考文獻